More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1769 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1769  cytochrome P450  100 
 
 		 395 aa  811    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  30.62 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.59 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33.68 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  31.92 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  33.67 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.42 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  31.99 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  32.09 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  31.52 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  29.28 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  29.78 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  29.78 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  29.53 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  29.53 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  31.14 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  34.48 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  32.32 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  32.42 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  28.61 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  29.28 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  28.43 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  28.61 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  29.28 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  32.43 
 
 		 410 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.43 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  28.81 
 
 		 410 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  31.28 
 
 		 439 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  34.86 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  29.51 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  31.72 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  28.99 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2032  cytochrome P450  29.7 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0674155  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  28.89 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  32.23 
 
 		 442 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.61 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  30.17 
 
 		 407 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  31.98 
 
 		 396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  29.87 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  33.07 
 
 		 409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4303  Cytochrome P450-like protein  30.49 
 
 		 432 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  30.75 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  30 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  32.18 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  31.7 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  28.97 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  30.24 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  30.24 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  28.08 
 
 		 408 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  29.34 
 
 		 380 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  32.26 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  30.24 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  34.5 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  33.54 
 
 		 417 aa  159  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  32.03 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  31.53 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  28.87 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.08 
 
 		 411 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  26.62 
 
 		 938 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0542  cytochrome P450  30.2 
 
 		 413 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.353046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  31.48 
 
 		 395 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0556  cytochrome P450 enzyme  30.2 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  28.64 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  31.83 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  30.05 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.95 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  30.52 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  30.05 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  30.48 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  31.25 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  33.75 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  30.59 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  29.84 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  31.36 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  32.83 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  30.75 
 
 		 417 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  30.33 
 
 		 403 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  30.37 
 
 		 405 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  31.94 
 
 		 407 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  29.7 
 
 		 388 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  29.9 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  30.15 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  29.21 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  29.1 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  26.1 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  32.33 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  32.08 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  31.3 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  30.31 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  33.23 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  30.85 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  33.23 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  29.21 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.23 
 
 		 407 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  28.12 
 
 		 414 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  33.73 
 
 		 442 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  28.91 
 
 		 415 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1485  cytochrome P450  30.09 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1507  cytochrome P450  30.09 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6329  cytochrome P450  32.27 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>