More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0598 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  100 
 
 
419 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  62.56 
 
 
395 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  49.01 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  44.64 
 
 
406 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  42.49 
 
 
388 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  42.9 
 
 
390 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  41.5 
 
 
395 aa  276  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  33.33 
 
 
408 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4845  cytochrome P450  39.21 
 
 
405 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  35.32 
 
 
380 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  35.4 
 
 
404 aa  235  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  32.58 
 
 
411 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  34.48 
 
 
403 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  39.32 
 
 
409 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  34.65 
 
 
404 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  33.57 
 
 
404 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  33.57 
 
 
404 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  33.57 
 
 
404 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  30.9 
 
 
411 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  37.62 
 
 
397 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  35.77 
 
 
404 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  31.39 
 
 
411 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.55 
 
 
410 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  35.51 
 
 
404 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  34.99 
 
 
404 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  40.37 
 
 
399 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  39.3 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.72 
 
 
411 aa  222  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  35.25 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  37.93 
 
 
411 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  37.93 
 
 
411 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  37.96 
 
 
402 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.93 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.93 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.62 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  37.62 
 
 
411 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.63 
 
 
412 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  40.38 
 
 
412 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37.3 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.92 
 
 
398 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  37.62 
 
 
411 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  45.54 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  40.32 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  37.3 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  42.09 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.38 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.3 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.69 
 
 
401 aa  213  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  38.4 
 
 
400 aa  212  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  42.19 
 
 
398 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  43.28 
 
 
413 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.6 
 
 
419 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.6 
 
 
405 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  41.12 
 
 
411 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  43.28 
 
 
412 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.34 
 
 
392 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.32 
 
 
420 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  37.53 
 
 
412 aa  206  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.48 
 
 
398 aa  206  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  40.46 
 
 
412 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  43.07 
 
 
416 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.52 
 
 
402 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.42 
 
 
423 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.3 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  41.69 
 
 
407 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  41.69 
 
 
407 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  41.69 
 
 
407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  41.75 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  37.28 
 
 
410 aa  196  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  37.11 
 
 
406 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  41.04 
 
 
405 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  36.36 
 
 
407 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  37.62 
 
 
402 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.92 
 
 
407 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40 
 
 
426 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  39.35 
 
 
429 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  41.64 
 
 
414 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.13 
 
 
417 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.51 
 
 
394 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  37.34 
 
 
430 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  37.42 
 
 
408 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.89 
 
 
410 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  36.13 
 
 
442 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  36.19 
 
 
418 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  39.6 
 
 
418 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  35.92 
 
 
401 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  39.69 
 
 
409 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  34.26 
 
 
405 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.77 
 
 
419 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  36.43 
 
 
410 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  30.92 
 
 
387 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  38.7 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  37.43 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  37.37 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  33.67 
 
 
408 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  37.2 
 
 
408 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.54 
 
 
406 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  37.05 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  36.31 
 
 
417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>