More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4845 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4845  cytochrome P450  100 
 
 
405 aa  796    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  42.59 
 
 
395 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  39.21 
 
 
419 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  39.45 
 
 
399 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.27 
 
 
388 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  35.75 
 
 
406 aa  215  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.16 
 
 
380 aa  213  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  30.15 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  29.24 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  28.43 
 
 
411 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  31.85 
 
 
390 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  36.43 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.97 
 
 
402 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  34.57 
 
 
395 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  36.32 
 
 
409 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  28.43 
 
 
411 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  37.89 
 
 
398 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  28.53 
 
 
411 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  31.82 
 
 
404 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  29.34 
 
 
403 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  32.57 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  31.65 
 
 
387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  31.93 
 
 
404 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.87 
 
 
400 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  32.32 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  32.32 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  32.32 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.96 
 
 
399 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.64 
 
 
392 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  31.27 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  32.53 
 
 
404 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  32.85 
 
 
404 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  37.89 
 
 
398 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  36.78 
 
 
405 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  36.78 
 
 
405 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  30.36 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  36.18 
 
 
408 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.43 
 
 
420 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.7 
 
 
407 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  35.26 
 
 
398 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.76 
 
 
410 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.64 
 
 
405 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  32.13 
 
 
405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.17 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  30.22 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  35.01 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  31.54 
 
 
412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  33.68 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  29.95 
 
 
411 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.08 
 
 
411 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  29.95 
 
 
411 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.08 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  31.73 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  34.41 
 
 
418 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  33.24 
 
 
401 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  35.14 
 
 
416 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  39.52 
 
 
400 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  34.41 
 
 
413 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  30.15 
 
 
422 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  35.73 
 
 
442 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  33.72 
 
 
402 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  29.27 
 
 
411 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  33.16 
 
 
409 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  28.85 
 
 
411 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  34.29 
 
 
428 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  35.06 
 
 
406 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  28.57 
 
 
411 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  31.44 
 
 
411 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  34.58 
 
 
394 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  34.29 
 
 
416 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  34.29 
 
 
416 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.25 
 
 
408 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  29.4 
 
 
411 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  33.42 
 
 
427 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  29.54 
 
 
411 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.16 
 
 
412 aa  159  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  34.64 
 
 
408 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  33.93 
 
 
405 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.29 
 
 
407 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  35.57 
 
 
401 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.29 
 
 
407 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.64 
 
 
412 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.1 
 
 
412 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  29.67 
 
 
411 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  33.59 
 
 
423 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  37.29 
 
 
407 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  33.15 
 
 
402 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  33.15 
 
 
402 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.43 
 
 
407 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  36.48 
 
 
406 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  31.07 
 
 
404 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  33.09 
 
 
445 aa  156  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  30.53 
 
 
406 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  30.53 
 
 
418 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  30.53 
 
 
406 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  33.73 
 
 
420 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  32.52 
 
 
414 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  32.47 
 
 
412 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.79 
 
 
404 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.79 
 
 
404 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>