More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2612 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  92.4 
 
 
408 aa  780    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  100 
 
 
408 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  59.95 
 
 
407 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  58.87 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  59.07 
 
 
411 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  60.25 
 
 
410 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  60 
 
 
423 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  58.82 
 
 
411 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  60 
 
 
423 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  58.82 
 
 
411 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  59.01 
 
 
414 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  60 
 
 
423 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  59.61 
 
 
416 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  58.87 
 
 
413 aa  494  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  58 
 
 
436 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  58.09 
 
 
417 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3974  cytochrome P450  58.01 
 
 
412 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  57.7 
 
 
419 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  57.39 
 
 
420 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  56.39 
 
 
419 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  56.64 
 
 
427 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  56.64 
 
 
427 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  56.64 
 
 
427 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  48.97 
 
 
401 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  43.81 
 
 
418 aa  349  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  45.61 
 
 
400 aa  342  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  45 
 
 
406 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  43.85 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  43.85 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  43.85 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  44.78 
 
 
415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  43.48 
 
 
434 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  43.29 
 
 
433 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  43.15 
 
 
428 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  43.14 
 
 
406 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  40 
 
 
427 aa  292  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  40.15 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  41.83 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  42.05 
 
 
416 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  39.44 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  39.44 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  42.4 
 
 
422 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  38.65 
 
 
414 aa  282  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  42.23 
 
 
424 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  38.78 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3600  cytochrome P450  40.1 
 
 
422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  38.62 
 
 
442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  39.44 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  37.11 
 
 
414 aa  269  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  37.6 
 
 
417 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  38.37 
 
 
431 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  37.15 
 
 
417 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7659  cytochrome P450 CYP124E1  43.8 
 
 
412 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  37.4 
 
 
417 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  37.4 
 
 
417 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7142  cytochrome P450 CYP124E1  40.05 
 
 
418 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  39.23 
 
 
412 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  39.47 
 
 
430 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  37.07 
 
 
417 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  36.66 
 
 
418 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  38.01 
 
 
414 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  37.13 
 
 
422 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  38.14 
 
 
414 aa  249  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  36.46 
 
 
401 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  38.88 
 
 
402 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  38.88 
 
 
402 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  37.47 
 
 
409 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  38.88 
 
 
402 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  37.03 
 
 
424 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  37.03 
 
 
424 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  37.03 
 
 
424 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  35.71 
 
 
403 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  38.72 
 
 
409 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3992  hypothetical protein  37.03 
 
 
429 aa  232  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.91 
 
 
399 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  35.87 
 
 
449 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.13 
 
 
398 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  37.53 
 
 
404 aa  230  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  32.5 
 
 
425 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  33.99 
 
 
412 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.37 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.63 
 
 
398 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.44 
 
 
405 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  34.44 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  34.44 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  34.44 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  34.68 
 
 
420 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  34.68 
 
 
420 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2722  cytochrome P450  33.74 
 
 
407 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  33.98 
 
 
412 aa  222  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  34.43 
 
 
420 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  34.24 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  33.92 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  34.18 
 
 
403 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  34.5 
 
 
416 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  34.5 
 
 
428 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  34.5 
 
 
416 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.21 
 
 
412 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.59 
 
 
392 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  32.58 
 
 
418 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>