108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1135 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 447 aa  911    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  51.16 
 
 		 460 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  44.82 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  44.22 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  38.36 
 
 		 469 aa  312  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  37.33 
 
 		 441 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  37.16 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  37.16 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  37.16 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  40.32 
 
 		 477 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  38.88 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  36.94 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  37.75 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  39.22 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  37.84 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  38.94 
 
 		 460 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  37.9 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  35.86 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  38.32 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  35.67 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  32.42 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  32.42 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  32.42 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  32.19 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  37.33 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  36.22 
 
 		 436 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  31.82 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  36.45 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  31.82 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  32.19 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  34.73 
 
 		 468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  34.62 
 
 		 468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  32.19 
 
 		 440 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  32.95 
 
 		 440 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  34.1 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  32.19 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  36.05 
 
 		 463 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  39.04 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  39.04 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  34.16 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  38.81 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  35.48 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  36.14 
 
 		 477 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  33.63 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  31.33 
 
 		 490 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  34.88 
 
 		 460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.83 
 
 		 844 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  30.94 
 
 		 839 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  33.18 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  36.73 
 
 		 447 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  33.18 
 
 		 449 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  32.13 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  30.77 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  31.45 
 
 		 462 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  31.45 
 
 		 462 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  31.18 
 
 		 462 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  35.69 
 
 		 468 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  30.96 
 
 		 558 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 446 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 472 aa  156  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  30.3 
 
 		 487 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  29.86 
 
 		 497 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  23.85 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  28.06 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  25.53 
 
 		 490 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  57.78 
 
 		 235 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  27.11 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  25.28 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  25.39 
 
 		 409 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  26.92 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  26.55 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  26.55 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  26.55 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  26.55 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  26.55 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.13 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  27.59 
 
 		 532 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  26.21 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  31.13 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0715  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family protein  24.22 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00886299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  27.08 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  29.52 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  23.11 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  24.78 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  27.75 
 
 		 416 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>