72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13283 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  944    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  69.33 
 
 
462 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  69.33 
 
 
462 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  69.33 
 
 
462 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  64.5 
 
 
449 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  40.24 
 
 
458 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  36.61 
 
 
484 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  37.04 
 
 
460 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  37.04 
 
 
460 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  37.04 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  35.43 
 
 
482 aa  212  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  35.42 
 
 
460 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  34.59 
 
 
444 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  36.18 
 
 
443 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  34.4 
 
 
459 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  34.68 
 
 
468 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  33.64 
 
 
460 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  31.63 
 
 
453 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  32.33 
 
 
449 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  31.81 
 
 
436 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  34.51 
 
 
471 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  29.74 
 
 
508 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  32.95 
 
 
468 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  32.13 
 
 
443 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  32.56 
 
 
460 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  32.55 
 
 
468 aa  176  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  31.58 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  31.28 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  29.65 
 
 
469 aa  173  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
447 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
477 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  31.95 
 
 
477 aa  167  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  31.76 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  34.97 
 
 
452 aa  163  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  29.89 
 
 
447 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
531 aa  156  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 
460 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  28.42 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  28.68 
 
 
440 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  29.22 
 
 
490 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  29.4 
 
 
460 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  28.17 
 
 
440 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  29.95 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  28.85 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  29.95 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  29.95 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  27.91 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  28.17 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  28.17 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  37.54 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  30.39 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  29.2 
 
 
440 aa  146  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
469 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  31.29 
 
 
558 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  33.68 
 
 
447 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  27.13 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  28.21 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  30.53 
 
 
468 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 
509 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
446 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  29.32 
 
 
839 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  35.74 
 
 
471 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.41 
 
 
844 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  30.35 
 
 
487 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
500 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  24.08 
 
 
497 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
437 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  58.14 
 
 
235 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
518 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>