79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4135 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 460 aa  885    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  41.98 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  36.53 
 
 		 469 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  47.04 
 
 		 447 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  34.68 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 457 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  35.81 
 
 		 463 aa  226  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  38.23 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  34.51 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  35.29 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  37.8 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  37.83 
 
 		 460 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  38.5 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 447 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  32.88 
 
 		 508 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  36.24 
 
 		 477 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  35.37 
 
 		 463 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  34.91 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  31.74 
 
 		 441 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  37.73 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  36.27 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  35.34 
 
 		 459 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  30.24 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  33.78 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  34.72 
 
 		 468 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  32.88 
 
 		 460 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  31.81 
 
 		 476 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  35.05 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  31.81 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  31.81 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  35.31 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  35.83 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  35.83 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  35.83 
 
 		 460 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  31.71 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  34.18 
 
 		 447 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  34.6 
 
 		 558 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  36.3 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 		 531 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  34.04 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  36.48 
 
 		 471 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  28.64 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  32.33 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  35.86 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  27.56 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  28.64 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  28.64 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  32.24 
 
 		 468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  28.57 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  28.64 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  28.41 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  29.09 
 
 		 440 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  27.79 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  31.47 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  31 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  30.57 
 
 		 462 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  26.82 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  30.05 
 
 		 462 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  30.05 
 
 		 462 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 472 aa  146  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  29 
 
 		 839 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.49 
 
 		 844 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  34.51 
 
 		 497 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  29.49 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  60 
 
 		 235 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  26.27 
 
 		 495 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  26.52 
 
 		 507 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  29.56 
 
 		 391 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>