More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2465 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  100 
 
 		 495 aa  1021    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  58.13 
 
 		 507 aa  557  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  37.59 
 
 		 413 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  36.71 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  37.53 
 
 		 506 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  37.22 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  38.93 
 
 		 439 aa  220  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  38.93 
 
 		 439 aa  220  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  37 
 
 		 480 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  37 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  37 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  37 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  36.28 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  36.46 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  38.25 
 
 		 449 aa  207  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.71 
 
 		 455 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  35.85 
 
 		 441 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  38.94 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  37.54 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  38.89 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.75 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  35.56 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  32.31 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  33.04 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  32.03 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  33.61 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  31.54 
 
 		 429 aa  169  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  34.01 
 
 		 429 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  31.92 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  33.72 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  33.72 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  35.67 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 		 647 aa  163  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  30.67 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  30.08 
 
 		 435 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 429 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  29.82 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  32.66 
 
 		 405 aa  162  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 417 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  33.06 
 
 		 439 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  31.4 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  34.32 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  33.33 
 
 		 424 aa  154  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  30.65 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  33.24 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  31.59 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  30.67 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  30.67 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  29.81 
 
 		 584 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 		 416 aa  150  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  32.98 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  32.8 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  29.77 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  29.61 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  30.05 
 
 		 415 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  29.74 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  30.65 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  33.13 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  31.99 
 
 		 414 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  29.8 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  30.71 
 
 		 414 aa  134  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  31.18 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  29.15 
 
 		 618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 417 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  29.49 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  30.6 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  28.1 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.97 
 
 		 430 aa  96.7  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.34 
 
 		 435 aa  94  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 376 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 431 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  29.04 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 431 aa  89.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 606 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 424 aa  86.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  26.28 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.71 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  26.21 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.18 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  25.71 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>