More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004059 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  100 
 
 		 414 aa  857    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  68.56 
 
 		 413 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  64.76 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  64.52 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  64.76 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  64.52 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  64.46 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  64.52 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  64.46 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  64.22 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  63.97 
 
 		 436 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  62.87 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  62.47 
 
 		 424 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  59.86 
 
 		 424 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  60.34 
 
 		 420 aa  508  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  59.12 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  58.62 
 
 		 420 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  58.62 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  58.62 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  57.6 
 
 		 409 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  53.83 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  56.9 
 
 		 410 aa  454  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  55.33 
 
 		 409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  54.05 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  53.79 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  53.58 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  51.34 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  51.34 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  52.06 
 
 		 419 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  51.73 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  52.12 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  48.07 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  49.25 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  47.34 
 
 		 415 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  42.79 
 
 		 413 aa  359  5e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  48.19 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  42.55 
 
 		 415 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  41.22 
 
 		 415 aa  335  7e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  39.56 
 
 		 415 aa  333  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  40.77 
 
 		 417 aa  312  7.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  39.66 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  32.29 
 
 		 461 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.23 
 
 		 455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  30.3 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  30.56 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  30.56 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.47 
 
 		 449 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  32.4 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  29.26 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  28.64 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  28.96 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.92 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  29.73 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  30.77 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  30.38 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  31.52 
 
 		 480 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  31.52 
 
 		 480 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 480 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  31.52 
 
 		 480 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  26.52 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29 
 
 		 506 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  29.68 
 
 		 495 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  29.88 
 
 		 507 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  29.46 
 
 		 647 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  28.13 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  28.89 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  24.8 
 
 		 413 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  27.58 
 
 		 584 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  27.45 
 
 		 568 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  25.07 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.73 
 
 		 401 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  24.17 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.41 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.41 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  24.79 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  26.48 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  26.61 
 
 		 618 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 606 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  25.48 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.48 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.53 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  24.41 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  24.36 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  23.35 
 
 		 552 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  23.35 
 
 		 552 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.85 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.35 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>