More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2822 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  100 
 
 
413 aa  849    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  62.04 
 
 
415 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  50.85 
 
 
415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  53.17 
 
 
415 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  50 
 
 
417 aa  438  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  48.31 
 
 
416 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  45.21 
 
 
415 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  44.72 
 
 
409 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 
429 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  44.88 
 
 
415 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  43.7 
 
 
409 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  44.07 
 
 
420 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  43.21 
 
 
429 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  43.21 
 
 
429 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  43.21 
 
 
429 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  42.79 
 
 
414 aa  359  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  42.58 
 
 
435 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  42.96 
 
 
429 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  42.68 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  42.34 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  42.44 
 
 
424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  42.44 
 
 
436 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  43.03 
 
 
424 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  42.07 
 
 
429 aa  352  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  41.48 
 
 
413 aa  351  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  42.12 
 
 
422 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  42.96 
 
 
420 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  44.99 
 
 
409 aa  345  8.999999999999999e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  42.54 
 
 
406 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  42.44 
 
 
419 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  42.44 
 
 
419 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  41.06 
 
 
416 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  42.26 
 
 
416 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  41.34 
 
 
410 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  43.87 
 
 
419 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  41.63 
 
 
405 aa  324  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  41.55 
 
 
415 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  41.3 
 
 
415 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  42.54 
 
 
414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  42.4 
 
 
414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 
417 aa  296  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.77 
 
 
455 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  28.87 
 
 
461 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  29.8 
 
 
444 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  30.69 
 
 
455 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  31.39 
 
 
444 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  33.53 
 
 
470 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  27.37 
 
 
439 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  27.37 
 
 
439 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.87 
 
 
445 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.56 
 
 
449 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  33.23 
 
 
491 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  30.56 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  30.36 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  27.86 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.35 
 
 
413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  28.31 
 
 
480 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  31.5 
 
 
507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  30.1 
 
 
417 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.72 
 
 
506 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  33.13 
 
 
495 aa  126  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  29.95 
 
 
439 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  28.12 
 
 
480 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  28.12 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  28.12 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  28.12 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 
647 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  26.2 
 
 
587 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 
563 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 
566 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.78 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
606 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
566 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
549 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 
566 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  26.21 
 
 
552 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  26.21 
 
 
552 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 
423 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  26.21 
 
 
552 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  25.95 
 
 
573 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  25.95 
 
 
552 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  25.95 
 
 
552 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  25.95 
 
 
552 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  26.74 
 
 
618 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  22.42 
 
 
540 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
549 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  21.39 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  24.5 
 
 
584 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.28 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.81 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.54 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>