133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6985 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  93.99 
 
 
566 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  95.05 
 
 
566 aa  1136    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  94.35 
 
 
566 aa  1124    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  93.82 
 
 
566 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  94.17 
 
 
566 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
566 aa  1184    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  94.52 
 
 
566 aa  1127    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  43.44 
 
 
549 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 
549 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  46.28 
 
 
552 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  46.1 
 
 
552 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  46.28 
 
 
552 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  46.28 
 
 
573 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  46.28 
 
 
552 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  46.1 
 
 
552 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  46.28 
 
 
552 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 
563 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 
606 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.35 
 
 
449 aa  101  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.63 
 
 
444 aa  96.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.14 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.87 
 
 
444 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.57 
 
 
455 aa  94.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  24.1 
 
 
413 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  25.44 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  25.44 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.57 
 
 
445 aa  85.9  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  25.85 
 
 
584 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  25.83 
 
 
618 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  24.43 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.57 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  24.73 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  25.2 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  22.77 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.16 
 
 
409 aa  80.1  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  22.87 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 
429 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  24.37 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.37 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  24.37 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  24.03 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  25.21 
 
 
416 aa  77  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  25.76 
 
 
417 aa  77  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  24.12 
 
 
435 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 
455 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  24.15 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  25.43 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  25.43 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.5 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  23.08 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  24.48 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  26.42 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  22.52 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  24.86 
 
 
416 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.71 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  24.51 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  24.6 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  24.18 
 
 
470 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  26.87 
 
 
507 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  21.2 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  23.93 
 
 
415 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  21.5 
 
 
415 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  25.51 
 
 
449 aa  64.3  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  23.33 
 
 
568 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.05 
 
 
384 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  24.23 
 
 
405 aa  63.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  22.45 
 
 
540 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  21.75 
 
 
491 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  22.86 
 
 
415 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  24.05 
 
 
415 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  23.38 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  22.78 
 
 
429 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  23.91 
 
 
415 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  21.69 
 
 
414 aa  58.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  22.78 
 
 
413 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 
696 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  23.39 
 
 
417 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  28.71 
 
 
474 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  23.82 
 
 
480 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  26.24 
 
 
416 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  24.61 
 
 
480 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  24.61 
 
 
480 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  24.61 
 
 
480 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  21.41 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  27.44 
 
 
515 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  22.42 
 
 
507 aa  53.9  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  25.21 
 
 
439 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28 
 
 
401 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  24.07 
 
 
506 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.7 
 
 
368 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  24.5 
 
 
499 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  21.63 
 
 
429 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  22.12 
 
 
538 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  23.83 
 
 
499 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  24.16 
 
 
499 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  22.12 
 
 
538 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>