290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0945 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  79.85 
 
 		 419 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  79.55 
 
 		 419 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  100 
 
 		 414 aa  850    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  95.41 
 
 		 414 aa  795    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  82.37 
 
 		 416 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  79.55 
 
 		 419 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  73.95 
 
 		 415 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  73.2 
 
 		 415 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  62.22 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  59.85 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  57.83 
 
 		 416 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  52.81 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  53.7 
 
 		 420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  54.11 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  53.71 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  54.11 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  53.66 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  53 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  53.87 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  53.17 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  53.41 
 
 		 435 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  54.11 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  51.95 
 
 		 429 aa  461  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  53.87 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  52.83 
 
 		 409 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  55.04 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  55.88 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  51.08 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  51.59 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  55.47 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  55.25 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  52.12 
 
 		 414 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  56.07 
 
 		 417 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  50.24 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  50.75 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  42.39 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  42.4 
 
 		 413 aa  328  8e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  41.65 
 
 		 415 aa  318  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  38.9 
 
 		 415 aa  304  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  38.64 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  37.22 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  33.42 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  33.42 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.08 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  32.27 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  31.44 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.01 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  34.1 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32 
 
 		 449 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.05 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  30.67 
 
 		 455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  31.4 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  32.05 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  30.49 
 
 		 495 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  32.42 
 
 		 507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 480 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  27.22 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  30.86 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 455 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  31.12 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  32.88 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 480 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  29.85 
 
 		 480 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  29.85 
 
 		 480 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  29.6 
 
 		 480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  28.73 
 
 		 587 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 647 aa  90.5  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  27.64 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 606 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  26.39 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.42 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  27.1 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  26.78 
 
 		 568 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  24.02 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  26.78 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  27.3 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  29.31 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 		 563 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.81 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  21.29 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  21.57 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  24.86 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  22.91 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  25.93 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  25.36 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.05 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>