More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4161 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  100 
 
 		 470 aa  964    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  54.26 
 
 		 491 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  45.95 
 
 		 480 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  46.36 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  46.36 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  46.36 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  46.36 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  41.33 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  37.12 
 
 		 647 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  40.21 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  36.61 
 
 		 495 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  37.37 
 
 		 413 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  39.51 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  33.02 
 
 		 476 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.97 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  38.97 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  37.27 
 
 		 439 aa  196  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  37.27 
 
 		 439 aa  196  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  37.65 
 
 		 455 aa  194  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  36.24 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  32.86 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  35.26 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  36.76 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  36.1 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  35.31 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  31.69 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  36.15 
 
 		 417 aa  177  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  35.82 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  36.7 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  33.63 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  32.56 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  34.32 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  33.53 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  33.04 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 410 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  31.58 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  30.47 
 
 		 584 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  31.29 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  32.46 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  31.16 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  31.29 
 
 		 429 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  31.29 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  30.99 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  33.73 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  32.24 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  31.9 
 
 		 405 aa  148  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  30.7 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  31.58 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  31.02 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  32.44 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  32.01 
 
 		 416 aa  144  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  32.4 
 
 		 618 aa  143  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  29.64 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  32.46 
 
 		 416 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  29.73 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  30.45 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.78 
 
 		 409 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  34.11 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  30.15 
 
 		 424 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  31.62 
 
 		 419 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  33.04 
 
 		 415 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  32.64 
 
 		 414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  32.44 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  32.05 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  28.44 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 		 488 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.18 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  25.88 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  26.17 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  24.29 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 606 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.5 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01926  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0983003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  27.73 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.58 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  24.45 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  26.61 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  26.88 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  27.89 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 566 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  23.03 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  26.01 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>