141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6353 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 606 aa  1248    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  38.65 
 
 		 566 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  38.46 
 
 		 566 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  38.46 
 
 		 566 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 566 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  38.69 
 
 		 552 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  38.69 
 
 		 552 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  38.69 
 
 		 552 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  38.69 
 
 		 552 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  38.69 
 
 		 573 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  38.69 
 
 		 552 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  38.49 
 
 		 552 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 563 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.03 
 
 		 455 aa  102  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  26.33 
 
 		 409 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  25.58 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  25 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 		 435 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  25.7 
 
 		 435 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.99 
 
 		 449 aa  98.2  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  25.21 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  26.56 
 
 		 439 aa  92  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  26.56 
 
 		 439 aa  92  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.29 
 
 		 445 aa  90.5  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.35 
 
 		 444 aa  90.5  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25.77 
 
 		 441 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.09 
 
 		 444 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  26.17 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  26.17 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.91 
 
 		 461 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  26.56 
 
 		 444 aa  88.6  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 429 aa  88.2  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  24.36 
 
 		 429 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  25.14 
 
 		 424 aa  87.4  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  24.36 
 
 		 429 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  26.3 
 
 		 416 aa  87  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  24.36 
 
 		 429 aa  87  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  24.94 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  24.04 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  25.49 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.08 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  26.03 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  23.74 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  25.36 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  23.4 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  23.45 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  24.22 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  26.01 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  25.53 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  23.63 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  24.07 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.12 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  23.37 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  22.01 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  22.11 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  22.95 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  25.77 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  23.8 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  23.26 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  22.17 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  25.84 
 
 		 414 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  24.65 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  25.28 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  23.04 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  24.3 
 
 		 584 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  21.35 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  23.46 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  22.75 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.43 
 
 		 413 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.04 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  23.39 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  21.64 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  23.39 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  23.39 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  23.39 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  23.39 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  23.1 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 		 417 aa  60.1  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  23.14 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  22.94 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  21.78 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  23.14 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  23.37 
 
 		 587 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  19.67 
 
 		 647 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  24.9 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  22.83 
 
 		 405 aa  55.5  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  22.02 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  22.02 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  20.5 
 
 		 430 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  22.02 
 
 		 428 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>