More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2237 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  68.59 
 
 		 444 aa  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  100 
 
 		 444 aa  925    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  64.34 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  64.06 
 
 		 455 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  61.45 
 
 		 439 aa  554  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  61.45 
 
 		 439 aa  554  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  61.5 
 
 		 449 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  57.71 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  55.61 
 
 		 455 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  50.68 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  41.59 
 
 		 461 aa  343  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  38.94 
 
 		 495 aa  190  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  35.26 
 
 		 470 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  35.95 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  32.92 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  32.92 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  39.27 
 
 		 507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 		 409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  32.02 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  32.13 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  30.89 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  30.67 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  32.99 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  32.73 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  32.13 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  30.92 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  30.3 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  30.2 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  27.8 
 
 		 429 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  31.22 
 
 		 420 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  30.81 
 
 		 587 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  29.64 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  33.96 
 
 		 424 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  29.31 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  30.6 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  32.31 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  31.04 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  30.68 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  29.77 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  30.53 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  30.53 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  31.7 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  30.03 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  28.94 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  27.36 
 
 		 424 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  29.41 
 
 		 439 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  28.18 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  28.17 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  30.95 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  30.05 
 
 		 415 aa  147  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  30.4 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 417 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 413 aa  140  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  31.83 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  31.83 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  31.83 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  31.55 
 
 		 480 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  31.59 
 
 		 584 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 		 647 aa  132  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  28.96 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  27.71 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  30.52 
 
 		 618 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 		 476 aa  96.7  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  27.49 
 
 		 540 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 549 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 566 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 566 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.02 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 606 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 566 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  26.61 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  24.14 
 
 		 566 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  24.14 
 
 		 566 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.47 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  24.14 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 549 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>