More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0332 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  84.06 
 
 
436 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  97.9 
 
 
429 aa  877    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  73.9 
 
 
424 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  99.77 
 
 
429 aa  891    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  73.28 
 
 
420 aa  648    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  94.16 
 
 
429 aa  837    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
429 aa  894    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  99.53 
 
 
429 aa  889    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  77.27 
 
 
424 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  85.42 
 
 
435 aa  768    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  85.42 
 
 
435 aa  770    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  80.88 
 
 
422 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  72.84 
 
 
420 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  85.42 
 
 
435 aa  767    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  71.05 
 
 
429 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  64.76 
 
 
414 aa  551  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  62.69 
 
 
413 aa  529  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  58.96 
 
 
409 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  58.5 
 
 
415 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  57.82 
 
 
416 aa  484  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  57.75 
 
 
415 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  60.5 
 
 
410 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  55.86 
 
 
409 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  55.42 
 
 
416 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  53.64 
 
 
419 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  53.64 
 
 
419 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  57.61 
 
 
405 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  56.08 
 
 
409 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  53.73 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  54.11 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  54.11 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  53.2 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  52.96 
 
 
415 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  52.84 
 
 
406 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  51.84 
 
 
417 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  44.2 
 
 
415 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  43.21 
 
 
413 aa  361  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  41.99 
 
 
415 aa  345  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  41.56 
 
 
415 aa  339  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  40.87 
 
 
417 aa  317  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  39.81 
 
 
416 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  32.21 
 
 
461 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  29.1 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.19 
 
 
455 aa  163  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  29.95 
 
 
441 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  30.41 
 
 
444 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  28.92 
 
 
444 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  29.59 
 
 
439 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  29.59 
 
 
439 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  31.35 
 
 
480 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  34.33 
 
 
507 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  29.95 
 
 
449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  33.43 
 
 
495 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  31.29 
 
 
470 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.09 
 
 
455 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  33.08 
 
 
417 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.9 
 
 
445 aa  143  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.06 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  31.11 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  31.11 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  31.11 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  31.11 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  28.28 
 
 
491 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
455 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.65 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  31.66 
 
 
647 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  32.81 
 
 
439 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  27.89 
 
 
506 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  27.05 
 
 
587 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 
563 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  27.03 
 
 
584 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.49 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
549 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 
376 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 
606 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 
549 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  26.26 
 
 
540 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  26.33 
 
 
568 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  28.01 
 
 
618 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.26 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
566 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  22.8 
 
 
515 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
566 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.37 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  23.15 
 
 
552 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  23.15 
 
 
552 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.21 
 
 
488 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.34 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  23.15 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  22.85 
 
 
573 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  23.81 
 
 
566 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  22.85 
 
 
552 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  23.81 
 
 
566 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  23.81 
 
 
566 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  22.85 
 
 
552 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  22.85 
 
 
552 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.93 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>