128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5266 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  95.05 
 
 		 566 aa  1136    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  93.64 
 
 		 566 aa  1120    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  98.59 
 
 		 566 aa  1174    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  94.88 
 
 		 566 aa  1135    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  95.23 
 
 		 566 aa  1137    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  94.52 
 
 		 566 aa  1127    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 566 aa  1188    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 		 549 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  42.43 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  45.07 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  44.88 
 
 		 552 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  45.07 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  45.07 
 
 		 573 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  45.07 
 
 		 552 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  44.88 
 
 		 552 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  45.07 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  40.7 
 
 		 563 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 606 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.35 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.45 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.32 
 
 		 455 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.85 
 
 		 455 aa  99.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.36 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  25 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  23.73 
 
 		 439 aa  91.3  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  23.73 
 
 		 439 aa  91.3  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.8 
 
 		 409 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  26.4 
 
 		 584 aa  89.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.62 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.27 
 
 		 445 aa  87  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  26.27 
 
 		 424 aa  87.4  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  25.82 
 
 		 618 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  23.77 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  24.4 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.4 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.69 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  23.42 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  24.12 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  24.09 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  24.15 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.09 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  24.09 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  24.12 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.68 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  26.1 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  23.28 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  23.24 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  25 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  24.48 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  23.73 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  25.5 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  25.5 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.9 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  22.48 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.98 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  21.47 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  26.76 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  24.93 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  26.59 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  25.21 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  23.98 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  23.63 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  21.78 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  23.21 
 
 		 470 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  23.21 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  24.09 
 
 		 405 aa  62  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  21.96 
 
 		 414 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  24.32 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  23.77 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  24.1 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  26.04 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  27.57 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  22.68 
 
 		 415 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  28.22 
 
 		 474 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.02 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  25.98 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  24.27 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  23.39 
 
 		 417 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  24.27 
 
 		 480 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  24.27 
 
 		 480 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  24.27 
 
 		 480 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  22.78 
 
 		 429 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  24.5 
 
 		 499 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  24.83 
 
 		 499 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  22.45 
 
 		 499 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  22.55 
 
 		 415 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 696 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  20.55 
 
 		 540 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 373 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  21.51 
 
 		 538 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  21.51 
 
 		 538 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  21 
 
 		 429 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  23.73 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>