133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2885 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  99.44 
 
 
538 aa  1115    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  92.74 
 
 
537 aa  1025    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  56.67 
 
 
529 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  92.57 
 
 
538 aa  1048    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  92.57 
 
 
538 aa  1045    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  100 
 
 
538 aa  1121    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  99.63 
 
 
538 aa  1118    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  92.01 
 
 
538 aa  1046    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  56.48 
 
 
529 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  34.91 
 
 
500 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  41.34 
 
 
501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  35.53 
 
 
492 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  35.45 
 
 
503 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  35.45 
 
 
503 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  37.04 
 
 
510 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  35.26 
 
 
503 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  35.26 
 
 
503 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  36.56 
 
 
504 aa  309  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  37.64 
 
 
496 aa  306  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  35.35 
 
 
496 aa  300  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  39.86 
 
 
509 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  34.1 
 
 
495 aa  297  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  37.42 
 
 
506 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  37.78 
 
 
509 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  34.5 
 
 
510 aa  294  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.86 
 
 
501 aa  294  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  38.27 
 
 
511 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  34.22 
 
 
506 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  37.11 
 
 
501 aa  289  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  34.75 
 
 
500 aa  289  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  39.21 
 
 
494 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  35.45 
 
 
505 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  36.94 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  35.95 
 
 
501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  35.47 
 
 
507 aa  287  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  36.9 
 
 
740 aa  286  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  35.84 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  39.17 
 
 
499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  37.73 
 
 
497 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  38.71 
 
 
499 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  36.61 
 
 
497 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  39.54 
 
 
518 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  36.22 
 
 
504 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  38.3 
 
 
499 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  37.24 
 
 
497 aa  280  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  35.37 
 
 
506 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  35.48 
 
 
504 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  40.74 
 
 
503 aa  277  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  35.14 
 
 
507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  33.52 
 
 
496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.78 
 
 
502 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  35.45 
 
 
505 aa  274  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  33.14 
 
 
498 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.88 
 
 
517 aa  273  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  35.53 
 
 
498 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.17 
 
 
498 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  35.21 
 
 
532 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  34.73 
 
 
511 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  33.77 
 
 
524 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  33.14 
 
 
505 aa  269  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
507 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.91 
 
 
522 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  34.35 
 
 
508 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
503 aa  267  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  36.24 
 
 
502 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  35.78 
 
 
505 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  37.47 
 
 
497 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  37.26 
 
 
503 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  36.33 
 
 
512 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  31.86 
 
 
513 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  31.85 
 
 
513 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.08 
 
 
508 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  31.86 
 
 
513 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  31.7 
 
 
501 aa  259  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  36.58 
 
 
502 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  37.5 
 
 
507 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  35.28 
 
 
505 aa  257  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
523 aa  256  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.33 
 
 
508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  29.39 
 
 
524 aa  253  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  32.16 
 
 
515 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  34.42 
 
 
507 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  34.26 
 
 
507 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  34.11 
 
 
497 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  31.74 
 
 
507 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  30.87 
 
 
518 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  29.25 
 
 
526 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  32.83 
 
 
515 aa  240  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  28.87 
 
 
517 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  30.68 
 
 
514 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  31.55 
 
 
527 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.63 
 
 
511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  27.12 
 
 
528 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  30.9 
 
 
508 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  29.1 
 
 
524 aa  230  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  30.47 
 
 
505 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  31.14 
 
 
522 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  30.67 
 
 
508 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  29.63 
 
 
508 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  32.2 
 
 
537 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>