125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1889 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  100 
 
 		 504 aa  1032    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  53.91 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  52.99 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  51.39 
 
 		 509 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  51.61 
 
 		 501 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  51.02 
 
 		 501 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  49.08 
 
 		 497 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  46.86 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  47.06 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  46.86 
 
 		 503 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  52.02 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  48.27 
 
 		 509 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  46.65 
 
 		 503 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  46.37 
 
 		 500 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  48.1 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  52.19 
 
 		 502 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  46.65 
 
 		 507 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  49.09 
 
 		 500 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  45.67 
 
 		 495 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  48.31 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  51.97 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  49.35 
 
 		 498 aa  488  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  51.73 
 
 		 523 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  47.25 
 
 		 510 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  48.48 
 
 		 499 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  48.48 
 
 		 499 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  48.48 
 
 		 499 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  46.23 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  48.7 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  47.78 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  49.8 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  44.44 
 
 		 502 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  49.7 
 
 		 497 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  47.05 
 
 		 740 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  46.28 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  44.69 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  46.84 
 
 		 492 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  47.57 
 
 		 507 aa  467  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  48.05 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  49.08 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  49.09 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  48.55 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  46.96 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  48.9 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  47.7 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  49.61 
 
 		 511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  44.58 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  47.77 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  47.57 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  46.54 
 
 		 512 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  42.86 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  43.09 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  42.66 
 
 		 505 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  40.56 
 
 		 502 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  41.9 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  39.8 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  38.7 
 
 		 511 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  41 
 
 		 499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  36.22 
 
 		 538 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.76 
 
 		 538 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  36.03 
 
 		 538 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.78 
 
 		 538 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  35.07 
 
 		 538 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.45 
 
 		 537 aa  276  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.25 
 
 		 538 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.82 
 
 		 529 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.61 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 517 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  38.85 
 
 		 532 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  32.12 
 
 		 498 aa  246  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  35.1 
 
 		 481 aa  246  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  38.71 
 
 		 522 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  35.53 
 
 		 524 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 506 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  37.63 
 
 		 524 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  34.44 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.49 
 
 		 499 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  34.96 
 
 		 505 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  30.95 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  33.49 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  30.41 
 
 		 502 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  34.4 
 
 		 526 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.98 
 
 		 507 aa  227  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  34.3 
 
 		 513 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  35.2 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  33.57 
 
 		 503 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 517 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  31.66 
 
 		 514 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 501 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  34.13 
 
 		 527 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  31.27 
 
 		 508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  34.79 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  32.3 
 
 		 537 aa  220  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  33.04 
 
 		 507 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.55 
 
 		 508 aa  220  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.84 
 
 		 511 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  31.13 
 
 		 507 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 508 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  28.85 
 
 		 508 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>