131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1096 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  100 
 
 		 498 aa  1043    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  57.26 
 
 		 510 aa  618  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  56.63 
 
 		 501 aa  609  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  55.44 
 
 		 502 aa  598  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  54.64 
 
 		 500 aa  587  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  52.61 
 
 		 509 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  52.71 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  53.71 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  50.4 
 
 		 495 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  50.7 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  53.43 
 
 		 503 aa  557  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  50.5 
 
 		 503 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  50.5 
 
 		 503 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  50.5 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  51.52 
 
 		 510 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  50.3 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  49.8 
 
 		 501 aa  535  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  49.19 
 
 		 506 aa  534  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  49.09 
 
 		 499 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  48.68 
 
 		 499 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  50.6 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  50.4 
 
 		 505 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  48.88 
 
 		 499 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  49.2 
 
 		 507 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  48.38 
 
 		 509 aa  525  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  49.39 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  47.87 
 
 		 497 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  49.5 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  49.9 
 
 		 740 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  49.49 
 
 		 507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  51.01 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  49.2 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  48.99 
 
 		 504 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  49.7 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  48.88 
 
 		 506 aa  508  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  47.49 
 
 		 496 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  47.7 
 
 		 496 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 502 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  48.88 
 
 		 497 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  50 
 
 		 502 aa  498  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  46.2 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  49.8 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  45.93 
 
 		 505 aa  488  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  47.06 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  46.96 
 
 		 523 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  47.05 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  46.95 
 
 		 501 aa  475  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  45.84 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  45.51 
 
 		 515 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  43.7 
 
 		 511 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  46.89 
 
 		 497 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  44.83 
 
 		 501 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  44.42 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  44.69 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  44.65 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  42.33 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  41.99 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  37.78 
 
 		 499 aa  329  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  36.2 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.34 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.53 
 
 		 538 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  35.34 
 
 		 538 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  35.31 
 
 		 538 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.11 
 
 		 538 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  38.46 
 
 		 537 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.57 
 
 		 529 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.36 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  36.08 
 
 		 508 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  35.69 
 
 		 505 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  35.88 
 
 		 508 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  35.52 
 
 		 507 aa  269  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.67 
 
 		 506 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.46 
 
 		 507 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  34.06 
 
 		 532 aa  259  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  34.05 
 
 		 524 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.76 
 
 		 498 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 508 aa  249  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.25 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.93 
 
 		 524 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 507 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  32.94 
 
 		 507 aa  242  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.68 
 
 		 502 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 511 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  32.35 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.97 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  32.89 
 
 		 524 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  32.53 
 
 		 537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  30.81 
 
 		 517 aa  230  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  31.95 
 
 		 507 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  31.17 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  32.21 
 
 		 501 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  32.15 
 
 		 499 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  31.56 
 
 		 527 aa  226  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  31.41 
 
 		 513 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  32.22 
 
 		 501 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 515 aa  225  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  31.97 
 
 		 503 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>