127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1290 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  100 
 
 
503 aa  1036    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  57.4 
 
 
501 aa  603  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  60 
 
 
501 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  56.35 
 
 
506 aa  589  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  55.33 
 
 
500 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  55.86 
 
 
510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  59.25 
 
 
505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  55.86 
 
 
509 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  56.8 
 
 
505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  52.93 
 
 
502 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  58.15 
 
 
511 aa  548  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  54.97 
 
 
509 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  55.56 
 
 
504 aa  548  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  51.89 
 
 
498 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  53.43 
 
 
498 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  50.2 
 
 
495 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  55.94 
 
 
497 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  49.9 
 
 
496 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  54.42 
 
 
505 aa  529  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  48.89 
 
 
502 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  49.3 
 
 
500 aa  527  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  51.94 
 
 
499 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  51.93 
 
 
510 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  50.4 
 
 
503 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  50.4 
 
 
503 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  51.53 
 
 
499 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  54.18 
 
 
518 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  51.22 
 
 
506 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  50.2 
 
 
503 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  50.2 
 
 
503 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  51.33 
 
 
499 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  49.41 
 
 
507 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  52.74 
 
 
497 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  50.81 
 
 
507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  50.51 
 
 
497 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  48.58 
 
 
494 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  50.7 
 
 
512 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  52.14 
 
 
502 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  48.9 
 
 
492 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  50.2 
 
 
501 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  50.2 
 
 
501 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  49.29 
 
 
740 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  51.12 
 
 
496 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  48.07 
 
 
496 aa  492  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  48.79 
 
 
505 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  47.51 
 
 
502 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  49.39 
 
 
497 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  46.2 
 
 
511 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  45.71 
 
 
503 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  48.37 
 
 
503 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  50.51 
 
 
523 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  49.48 
 
 
501 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  49.09 
 
 
504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  45.86 
 
 
497 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  45.51 
 
 
515 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  45.25 
 
 
504 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  43.53 
 
 
505 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  40.85 
 
 
499 aa  350  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  39.04 
 
 
481 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  40.51 
 
 
538 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  40.51 
 
 
538 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  40.74 
 
 
538 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  40.27 
 
 
538 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  36.23 
 
 
529 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  39.95 
 
 
538 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  36.23 
 
 
529 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  39.35 
 
 
538 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  35.23 
 
 
502 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  40.32 
 
 
537 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  36.07 
 
 
506 aa  266  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  39.09 
 
 
532 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.14 
 
 
508 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.42 
 
 
517 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.76 
 
 
505 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.57 
 
 
508 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  36.3 
 
 
501 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  36.68 
 
 
499 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  36.3 
 
 
501 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  36.15 
 
 
503 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.61 
 
 
507 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  37.92 
 
 
524 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  34.77 
 
 
522 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  32.22 
 
 
498 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  35.11 
 
 
527 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  33 
 
 
524 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  34.71 
 
 
518 aa  228  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  33.06 
 
 
517 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  32.87 
 
 
514 aa  226  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.49 
 
 
508 aa  226  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  34.58 
 
 
524 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  34.78 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  32.02 
 
 
525 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  36.58 
 
 
513 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  34.78 
 
 
508 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  33.33 
 
 
522 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  34.2 
 
 
507 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  33.52 
 
 
537 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  35.44 
 
 
510 aa  217  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  35.84 
 
 
511 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  31.04 
 
 
513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>