128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1309 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  59.55 
 
 		 494 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  58.78 
 
 		 496 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  79.72 
 
 		 500 aa  860    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  64.81 
 
 		 740 aa  695    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  61.79 
 
 		 496 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  64.36 
 
 		 498 aa  685    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  58.86 
 
 		 510 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  63.52 
 
 		 492 aa  682    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  100 
 
 		 495 aa  1039    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  83.54 
 
 		 503 aa  891    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  83.33 
 
 		 503 aa  890    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  83.54 
 
 		 503 aa  891    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  83.33 
 
 		 503 aa  890    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  57.67 
 
 		 523 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  55.24 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  57.44 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  55.1 
 
 		 497 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  50 
 
 		 502 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  52.15 
 
 		 506 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  50.3 
 
 		 504 aa  539  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  51.12 
 
 		 497 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  50.3 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  50.1 
 
 		 499 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  49.49 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  50.4 
 
 		 498 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  48.7 
 
 		 510 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  50.1 
 
 		 499 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  50.2 
 
 		 503 aa  524  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  48.25 
 
 		 497 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  46.83 
 
 		 509 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  48.29 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  47.61 
 
 		 502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  46.91 
 
 		 507 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  47.29 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  46.87 
 
 		 505 aa  495  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  46.69 
 
 		 509 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  46.79 
 
 		 501 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  45.67 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  47.07 
 
 		 497 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  46.26 
 
 		 497 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  45.4 
 
 		 501 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  47.4 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  46.25 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  45.88 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  45.4 
 
 		 502 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  44.74 
 
 		 507 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  44.75 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  46.03 
 
 		 518 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  44.42 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  42.8 
 
 		 512 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  43.06 
 
 		 515 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  43.44 
 
 		 511 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  43.71 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  42.04 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  40.57 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  40.37 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  42.08 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  38.31 
 
 		 499 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  34.29 
 
 		 538 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  34.1 
 
 		 538 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.42 
 
 		 538 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  33.84 
 
 		 538 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35 
 
 		 538 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.81 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.36 
 
 		 537 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.46 
 
 		 529 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.2 
 
 		 502 aa  266  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.61 
 
 		 517 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  31.69 
 
 		 481 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  34.74 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 522 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  34.31 
 
 		 514 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 505 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  35.71 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  34.32 
 
 		 513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 527 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  34.39 
 
 		 513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.32 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  34.18 
 
 		 513 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  33.61 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  34.45 
 
 		 513 aa  229  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  35.55 
 
 		 524 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  31.76 
 
 		 508 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  31.65 
 
 		 507 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.45 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.26 
 
 		 526 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  34.06 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  31.85 
 
 		 508 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  32.23 
 
 		 510 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  31.32 
 
 		 517 aa  223  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  30.77 
 
 		 507 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  31.96 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.86 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.14 
 
 		 511 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  32.54 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>