131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1022 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  100 
 
 		 524 aa  1097    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  47.72 
 
 		 524 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  46.76 
 
 		 518 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  46.53 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  44.64 
 
 		 526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  44.59 
 
 		 517 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  45.99 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  44.27 
 
 		 522 aa  455  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  46.55 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  44.11 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  42.37 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  42.33 
 
 		 543 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  42.57 
 
 		 543 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  41.47 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  41.96 
 
 		 543 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  43.41 
 
 		 513 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  42.52 
 
 		 532 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  43.41 
 
 		 513 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  41.34 
 
 		 537 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  42.3 
 
 		 514 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  41.73 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  43.22 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  42.99 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  42.61 
 
 		 508 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  41.21 
 
 		 531 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  41.17 
 
 		 524 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  42.94 
 
 		 527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  39.58 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  40 
 
 		 522 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  40.34 
 
 		 520 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  40.66 
 
 		 507 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  39.34 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  41 
 
 		 508 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  39.49 
 
 		 505 aa  379  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  39.04 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  38.76 
 
 		 513 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  40.25 
 
 		 507 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  39.06 
 
 		 507 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  40.7 
 
 		 515 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  39.81 
 
 		 511 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  36.36 
 
 		 537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  39.61 
 
 		 510 aa  343  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.23 
 
 		 508 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 505 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  30.36 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.59 
 
 		 508 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  30.17 
 
 		 538 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  30.53 
 
 		 538 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  29.58 
 
 		 538 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  31.18 
 
 		 529 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  29.58 
 
 		 538 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  31 
 
 		 529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  29.39 
 
 		 538 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.62 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  31.67 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  30.15 
 
 		 537 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  35.46 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  34.69 
 
 		 499 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  32.88 
 
 		 510 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.43 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 501 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.67 
 
 		 499 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.88 
 
 		 499 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.8 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  33.03 
 
 		 507 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  32.14 
 
 		 498 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  31.69 
 
 		 504 aa  237  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  31.69 
 
 		 517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 500 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 506 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  30.98 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  31.79 
 
 		 503 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  31.24 
 
 		 507 aa  230  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  32.51 
 
 		 515 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  32.69 
 
 		 498 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  32.2 
 
 		 502 aa  230  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  33.41 
 
 		 505 aa  228  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  30.8 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.45 
 
 		 495 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  30.23 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  30.02 
 
 		 496 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  29.17 
 
 		 509 aa  225  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 511 aa  225  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  31.76 
 
 		 496 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.38 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  31.42 
 
 		 497 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  31.36 
 
 		 497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  30.89 
 
 		 503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  30.89 
 
 		 503 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  30.89 
 
 		 503 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  30.69 
 
 		 503 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  29.55 
 
 		 505 aa  223  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  33 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  31.92 
 
 		 506 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  33.83 
 
 		 740 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  31.37 
 
 		 496 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  32.33 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>