124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03613 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  100 
 
 
509 aa  1054    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  55.42 
 
 
504 aa  601  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  56.09 
 
 
510 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  56.11 
 
 
502 aa  594  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  54.62 
 
 
500 aa  588  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  54.11 
 
 
509 aa  571  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  55.86 
 
 
503 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  53.68 
 
 
501 aa  551  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  54 
 
 
497 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  52.56 
 
 
498 aa  549  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  49.8 
 
 
496 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  53.41 
 
 
501 aa  547  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  49.9 
 
 
494 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  51.62 
 
 
499 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  50.2 
 
 
498 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  51.62 
 
 
499 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  51.62 
 
 
499 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  51 
 
 
510 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  46.83 
 
 
495 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  53.47 
 
 
505 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  55.62 
 
 
511 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  48.63 
 
 
507 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  52.32 
 
 
507 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  47.5 
 
 
496 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  51.39 
 
 
504 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  52.11 
 
 
505 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  51.98 
 
 
506 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  52.69 
 
 
518 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  49.9 
 
 
496 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  49.4 
 
 
497 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  53.23 
 
 
502 aa  525  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  47.62 
 
 
503 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  47.62 
 
 
503 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  47.42 
 
 
503 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  47.42 
 
 
503 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  49.6 
 
 
502 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  49.29 
 
 
506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  49.5 
 
 
505 aa  514  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  45.38 
 
 
500 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  49.5 
 
 
497 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  52.68 
 
 
505 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  48.5 
 
 
492 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  47.27 
 
 
740 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  49.4 
 
 
497 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  49.49 
 
 
523 aa  480  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  47.06 
 
 
503 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  46 
 
 
497 aa  472  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  47.49 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  48.19 
 
 
501 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  47.98 
 
 
501 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  44.66 
 
 
502 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  47.29 
 
 
501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  42.8 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  43.84 
 
 
515 aa  438  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  42.54 
 
 
503 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  43.71 
 
 
504 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  40.04 
 
 
505 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  40.73 
 
 
499 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.53 
 
 
538 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  37.78 
 
 
538 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  37.37 
 
 
538 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  37.37 
 
 
538 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.68 
 
 
529 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.27 
 
 
529 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.55 
 
 
538 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.55 
 
 
538 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.25 
 
 
537 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  35.29 
 
 
481 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.12 
 
 
517 aa  256  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.06 
 
 
502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  36.75 
 
 
532 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  30.74 
 
 
508 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  30.93 
 
 
508 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  30.73 
 
 
505 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  36.07 
 
 
499 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  37.36 
 
 
524 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  35.08 
 
 
501 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  35.68 
 
 
501 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  32.77 
 
 
514 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
543 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  31.63 
 
 
506 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  34.68 
 
 
503 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  32.37 
 
 
507 aa  236  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  33.79 
 
 
543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  32.25 
 
 
527 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  32.43 
 
 
507 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  34.3 
 
 
522 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  35.17 
 
 
507 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  32.07 
 
 
522 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  34.52 
 
 
526 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  29.17 
 
 
524 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  31.53 
 
 
508 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  35.29 
 
 
514 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  32.74 
 
 
525 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  30.75 
 
 
508 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  32.96 
 
 
537 aa  230  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  32.88 
 
 
543 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  31.76 
 
 
507 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  33.27 
 
 
543 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  30.95 
 
 
498 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>