127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4092 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  100 
 
 
497 aa  1015    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  58.2 
 
 
504 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  57.29 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  53.59 
 
 
509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  52.3 
 
 
502 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  52.93 
 
 
500 aa  548  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  53.29 
 
 
501 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  50.51 
 
 
497 aa  535  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
499 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  55.67 
 
 
503 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  50.51 
 
 
499 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  48.2 
 
 
500 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  50.91 
 
 
499 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  52.16 
 
 
506 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  50.72 
 
 
496 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  51.52 
 
 
510 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  49.39 
 
 
503 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  56.6 
 
 
505 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  54.47 
 
 
501 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  49.39 
 
 
503 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  49.7 
 
 
498 aa  524  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  48.32 
 
 
507 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  49.39 
 
 
503 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  49.39 
 
 
503 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  48.58 
 
 
494 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  50.4 
 
 
498 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  51.92 
 
 
509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  52.43 
 
 
505 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  48.9 
 
 
502 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  48.28 
 
 
740 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  51.41 
 
 
504 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  50.51 
 
 
496 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  48.98 
 
 
503 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  50.6 
 
 
506 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  48.68 
 
 
505 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  46.26 
 
 
495 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  51.29 
 
 
512 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  54.08 
 
 
511 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  51.11 
 
 
505 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  45.05 
 
 
496 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  53.03 
 
 
502 aa  484  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  48.09 
 
 
497 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  47.47 
 
 
492 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  50 
 
 
518 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  47.75 
 
 
497 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  48.26 
 
 
523 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  47.2 
 
 
502 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  48.88 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  48.58 
 
 
501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  44.49 
 
 
497 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  47.17 
 
 
507 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  43.56 
 
 
511 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  44.89 
 
 
501 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  42.31 
 
 
505 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  42.97 
 
 
515 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  43.43 
 
 
504 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  41.16 
 
 
503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  40.56 
 
 
499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  36.8 
 
 
538 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  36.8 
 
 
538 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  36.61 
 
 
538 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  36.94 
 
 
538 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  35.71 
 
 
538 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.91 
 
 
538 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  36.99 
 
 
537 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  37.45 
 
 
481 aa  279  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.92 
 
 
529 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.92 
 
 
529 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 
502 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  30.59 
 
 
505 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.92 
 
 
506 aa  230  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.46 
 
 
508 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.46 
 
 
508 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.7 
 
 
507 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  34.13 
 
 
532 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  36.09 
 
 
524 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  32.95 
 
 
499 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  34.01 
 
 
537 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  31.59 
 
 
517 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  35.8 
 
 
513 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  32.42 
 
 
503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  34.24 
 
 
522 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  32.79 
 
 
501 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.18 
 
 
501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  33.55 
 
 
527 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  33.19 
 
 
507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  30.43 
 
 
524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  30.77 
 
 
498 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  33.4 
 
 
518 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  31.64 
 
 
508 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
508 aa  206  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  29.73 
 
 
514 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  33.26 
 
 
513 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  34.92 
 
 
505 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  33.05 
 
 
513 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.18 
 
 
508 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  33.05 
 
 
513 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  29.79 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.35 
 
 
508 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  31.71 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>