127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3936 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  100 
 
 		 511 aa  1064    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  45.28 
 
 		 512 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  46.2 
 
 		 503 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  44.58 
 
 		 506 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  44.29 
 
 		 501 aa  465  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  41.8 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  44.88 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  43.79 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  45.09 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  44.36 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  42.38 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  42.72 
 
 		 500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  43.37 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  42.83 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  42.52 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  43.31 
 
 		 502 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  42.8 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  43.88 
 
 		 500 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  44.2 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  43.63 
 
 		 515 aa  438  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  42.89 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  43.93 
 
 		 511 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  43.44 
 
 		 495 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  43.91 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  43.37 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  43.74 
 
 		 497 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  43.03 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  42.8 
 
 		 509 aa  435  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  43.71 
 
 		 499 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  43.03 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  43.71 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  41.67 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  42.06 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  43.7 
 
 		 498 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  42.18 
 
 		 507 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  43.03 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  42.83 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  40 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  41.99 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  40.48 
 
 		 502 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  41.47 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  43.23 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  40.67 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  42.35 
 
 		 740 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  39.44 
 
 		 507 aa  415  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  40.52 
 
 		 503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  39.57 
 
 		 496 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  37.89 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  39.8 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  39.6 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  40.84 
 
 		 506 aa  402  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  40.64 
 
 		 518 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  39.96 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  38.54 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  38.7 
 
 		 504 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  39.76 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  38.78 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  36.72 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  38.05 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  38.27 
 
 		 538 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  37.83 
 
 		 538 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  37.83 
 
 		 538 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  35.19 
 
 		 538 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.38 
 
 		 538 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.94 
 
 		 537 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 517 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.78 
 
 		 502 aa  259  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  34.58 
 
 		 527 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  32.83 
 
 		 524 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.7 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.7 
 
 		 529 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.22 
 
 		 498 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  29.8 
 
 		 481 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 506 aa  246  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  33.85 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.53 
 
 		 508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  33.74 
 
 		 524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  34.74 
 
 		 507 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  34.23 
 
 		 508 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  33.88 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  32.86 
 
 		 517 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  34.59 
 
 		 508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  31.47 
 
 		 526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  29.77 
 
 		 499 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 518 aa  232  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  29.54 
 
 		 503 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  32.96 
 
 		 522 aa  230  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  32.57 
 
 		 514 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  31.22 
 
 		 501 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  32.52 
 
 		 513 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  34.09 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.59 
 
 		 513 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  29.17 
 
 		 522 aa  226  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  33.41 
 
 		 513 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  31 
 
 		 501 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  30.57 
 
 		 531 aa  226  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>