126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3817 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  100 
 
 		 497 aa  1040    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  56.45 
 
 		 496 aa  618  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  58.11 
 
 		 506 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  49.49 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  49.09 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  48.69 
 
 		 499 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  51.01 
 
 		 497 aa  521  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  49.2 
 
 		 507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  50.1 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  48.79 
 
 		 503 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 503 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 503 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  48.79 
 
 		 503 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  47.07 
 
 		 495 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  47 
 
 		 500 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  48.88 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  48.17 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  49.8 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  47.57 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  46.86 
 
 		 504 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  46.42 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  47.88 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  47.17 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  45.21 
 
 		 492 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  46 
 
 		 509 aa  480  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  48.05 
 
 		 504 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  46.84 
 
 		 503 aa  475  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  47.14 
 
 		 523 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  46.12 
 
 		 740 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  46.34 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  46.53 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  45.45 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  45.09 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  44.11 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  46.06 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  46.67 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  45.82 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  45.56 
 
 		 506 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  47.09 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  44.04 
 
 		 518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  44.17 
 
 		 497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  44.08 
 
 		 497 aa  445  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  45.1 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  43.47 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  44.83 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  42.48 
 
 		 515 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  41.33 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  40.77 
 
 		 502 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  42.66 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  42.63 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  40.2 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  39.8 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  40.12 
 
 		 512 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  39.76 
 
 		 511 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  40.89 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  40.2 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  38.7 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  38.14 
 
 		 499 aa  299  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  37.73 
 
 		 538 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  37.73 
 
 		 538 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  37.56 
 
 		 538 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  37.73 
 
 		 538 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  37.56 
 
 		 538 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  37.33 
 
 		 538 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  38.27 
 
 		 537 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  35.11 
 
 		 529 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  35.11 
 
 		 529 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.13 
 
 		 517 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.73 
 
 		 506 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  36.21 
 
 		 532 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.06 
 
 		 502 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  36.38 
 
 		 524 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.82 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  32.16 
 
 		 522 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.63 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.24 
 
 		 508 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 507 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  34.62 
 
 		 514 aa  243  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.61 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  35.62 
 
 		 524 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  32.79 
 
 		 498 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.71 
 
 		 507 aa  237  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  33.48 
 
 		 527 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  32.63 
 
 		 508 aa  233  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  32.81 
 
 		 515 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  33.4 
 
 		 507 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  32.61 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  32.77 
 
 		 526 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 537 aa  227  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  33.69 
 
 		 505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  32.16 
 
 		 522 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  31.03 
 
 		 507 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  33.76 
 
 		 524 aa  223  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  31.85 
 
 		 508 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.3 
 
 		 508 aa  223  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  31.7 
 
 		 513 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  32.42 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 513 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>