132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2208 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  100 
 
 		 502 aa  1045    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  57.6 
 
 		 507 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  55.53 
 
 		 497 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  56.25 
 
 		 499 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  56.25 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  56.25 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  50 
 
 		 504 aa  531  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  48.8 
 
 		 496 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  48.89 
 
 		 503 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  48.09 
 
 		 500 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  48.6 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  47.88 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  47.61 
 
 		 495 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  49.6 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  48.79 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  46.43 
 
 		 500 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  47.41 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  47.41 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  47.41 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  47.41 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  48.7 
 
 		 496 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  47.7 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  46.83 
 
 		 740 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  49.09 
 
 		 506 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  48.28 
 
 		 498 aa  497  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  47.09 
 
 		 510 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  46.67 
 
 		 497 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  48.9 
 
 		 497 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  45.97 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  46.06 
 
 		 492 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  45.92 
 
 		 507 aa  483  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  44.33 
 
 		 506 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  44.18 
 
 		 505 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  47.62 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  44.85 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  44.44 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  47.51 
 
 		 511 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  46.26 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  44.67 
 
 		 501 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  46.2 
 
 		 498 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  44.38 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  44.44 
 
 		 523 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  43.84 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  45.47 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  44.98 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  45.18 
 
 		 497 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  42.89 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  42.8 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  44.38 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  41.5 
 
 		 518 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  42.69 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  43.35 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  40.93 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  40.93 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  41.45 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  41.73 
 
 		 515 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  37.5 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  40.68 
 
 		 499 aa  362  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  37.36 
 
 		 529 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  36.94 
 
 		 538 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  36.94 
 
 		 538 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  37.36 
 
 		 529 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  36.94 
 
 		 538 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  36.62 
 
 		 538 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  37.5 
 
 		 538 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  37.05 
 
 		 538 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  37.67 
 
 		 537 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  30.69 
 
 		 481 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  34.61 
 
 		 508 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.73 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  35.18 
 
 		 502 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.21 
 
 		 508 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  36.13 
 
 		 527 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  36.56 
 
 		 498 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  35.86 
 
 		 522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.57 
 
 		 517 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  34.77 
 
 		 532 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.14 
 
 		 506 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 507 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  31.08 
 
 		 513 aa  226  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  33.11 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  35.03 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  34.46 
 
 		 513 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  34.02 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  32.24 
 
 		 528 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  34.08 
 
 		 513 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  34.08 
 
 		 513 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  34.41 
 
 		 501 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  32.95 
 
 		 507 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.72 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  32.12 
 
 		 543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.4 
 
 		 508 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  32.37 
 
 		 514 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  32.14 
 
 		 507 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  32.32 
 
 		 524 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  31.76 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.31 
 
 		 508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>