133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1115 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  100 
 
 
538 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  92.74 
 
 
537 aa  1025    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  92.75 
 
 
538 aa  1050    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  92.75 
 
 
538 aa  1048    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  56.48 
 
 
529 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  99.44 
 
 
538 aa  1115    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  99.81 
 
 
538 aa  1118    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  92.01 
 
 
538 aa  1045    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  56.29 
 
 
529 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  35.16 
 
 
500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  35.73 
 
 
492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  41.11 
 
 
501 aa  313  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  35.63 
 
 
503 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  35.63 
 
 
503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  35.45 
 
 
503 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  35.45 
 
 
503 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  36.66 
 
 
510 aa  307  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  36.36 
 
 
504 aa  306  6e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  37.84 
 
 
496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  35.55 
 
 
496 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  34.42 
 
 
495 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  34.7 
 
 
510 aa  296  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  39.63 
 
 
509 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  37.21 
 
 
506 aa  294  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.67 
 
 
501 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  37.37 
 
 
509 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  34.41 
 
 
506 aa  290  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  37.83 
 
 
511 aa  289  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  36.91 
 
 
501 aa  289  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  34.56 
 
 
500 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  39.44 
 
 
494 aa  287  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  35.76 
 
 
501 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  36.94 
 
 
502 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  35.84 
 
 
502 aa  286  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  35.47 
 
 
507 aa  286  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  35.26 
 
 
505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  36.9 
 
 
740 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  37.73 
 
 
497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  39.17 
 
 
499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  36.8 
 
 
497 aa  282  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  38.71 
 
 
499 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  39.31 
 
 
518 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  38.3 
 
 
499 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  35.76 
 
 
504 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  37.24 
 
 
497 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  35.57 
 
 
506 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  40.51 
 
 
503 aa  277  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  35.48 
 
 
504 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  33.53 
 
 
498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.94 
 
 
507 aa  274  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.97 
 
 
502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  33.52 
 
 
496 aa  272  9e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  35.12 
 
 
505 aa  272  9e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  35.34 
 
 
498 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.88 
 
 
517 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  34.54 
 
 
511 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.17 
 
 
498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  35.41 
 
 
532 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  33.96 
 
 
524 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.97 
 
 
522 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
507 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  32.94 
 
 
505 aa  267  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  36.24 
 
 
502 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  34.23 
 
 
508 aa  266  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
503 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  35.59 
 
 
505 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  37.24 
 
 
497 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  36.33 
 
 
512 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  37.26 
 
 
503 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  31.86 
 
 
513 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.08 
 
 
508 aa  261  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  31.85 
 
 
513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  31.86 
 
 
513 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  33.2 
 
 
523 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  36.34 
 
 
502 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  31.7 
 
 
501 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  29.58 
 
 
524 aa  255  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  37.22 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  35.06 
 
 
505 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.33 
 
 
508 aa  253  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  34.26 
 
 
507 aa  251  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  31.96 
 
 
515 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  34.2 
 
 
507 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  34.11 
 
 
497 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  31.25 
 
 
518 aa  247  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  31.74 
 
 
507 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  29.25 
 
 
526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  32.47 
 
 
515 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  28.87 
 
 
517 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.85 
 
 
511 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  30.68 
 
 
514 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  31.55 
 
 
527 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  27.12 
 
 
528 aa  233  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  31.31 
 
 
510 aa  230  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  30.69 
 
 
508 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  29.24 
 
 
524 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  31.14 
 
 
522 aa  228  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  30.47 
 
 
505 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  32.2 
 
 
537 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  33.26 
 
 
501 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>