126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0588 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 502 aa  1054    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  46.36 
 
 		 517 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  44.95 
 
 		 498 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  44.29 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  42.48 
 
 		 499 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  41.9 
 
 		 503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  42.08 
 
 		 501 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  42.08 
 
 		 501 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  33.78 
 
 		 538 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  33.97 
 
 		 538 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  33.97 
 
 		 538 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.89 
 
 		 538 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.89 
 
 		 538 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  34.53 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  32.1 
 
 		 505 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.17 
 
 		 538 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  34 
 
 		 510 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  35.19 
 
 		 503 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.41 
 
 		 537 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  35.19 
 
 		 503 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  34.98 
 
 		 503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  34.98 
 
 		 503 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 498 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  32.87 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  33.19 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  35.23 
 
 		 503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  34.2 
 
 		 495 aa  266  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  32.09 
 
 		 500 aa  266  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  33.91 
 
 		 492 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 502 aa  263  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  35.51 
 
 		 506 aa  259  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  32.78 
 
 		 511 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  32.45 
 
 		 499 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  32.4 
 
 		 740 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  35.54 
 
 		 505 aa  256  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  32.38 
 
 		 499 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  34.84 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  35.68 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.23 
 
 		 494 aa  253  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  32.01 
 
 		 522 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  31.73 
 
 		 529 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  32.86 
 
 		 503 aa  253  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  31.73 
 
 		 529 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  33.19 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  32.54 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  33.86 
 
 		 506 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 497 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  35.18 
 
 		 502 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  31.55 
 
 		 505 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  29.17 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  30.74 
 
 		 504 aa  250  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  32.98 
 
 		 514 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  31.06 
 
 		 509 aa  249  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  32.83 
 
 		 515 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  33.1 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  32.09 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  31.86 
 
 		 507 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.26 
 
 		 509 aa  246  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  32.06 
 
 		 514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  34.12 
 
 		 496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  34.6 
 
 		 527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  32.02 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  31.3 
 
 		 502 aa  243  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  31.27 
 
 		 497 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  32.67 
 
 		 523 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  31.97 
 
 		 501 aa  240  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  32.91 
 
 		 526 aa  240  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  31.97 
 
 		 503 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  33.19 
 
 		 518 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  31.1 
 
 		 511 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  34.29 
 
 		 513 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  34.37 
 
 		 513 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  34.81 
 
 		 513 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  33.12 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34 
 
 		 508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  31.17 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.88 
 
 		 507 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.48 
 
 		 507 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.88 
 
 		 508 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  31.36 
 
 		 497 aa  233  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  32.51 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  30.45 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  31.49 
 
 		 507 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  35.6 
 
 		 510 aa  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  29.31 
 
 		 501 aa  230  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  32.39 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  30.41 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  31.59 
 
 		 508 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  36.04 
 
 		 515 aa  227  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  34.49 
 
 		 507 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  31.4 
 
 		 543 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  31.66 
 
 		 522 aa  227  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  29.62 
 
 		 525 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.1 
 
 		 508 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  30.64 
 
 		 520 aa  226  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  31.9 
 
 		 543 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  30.54 
 
 		 524 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>