126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01880 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  65.03 
 
 		 496 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  100 
 
 		 506 aa  1055    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  58.11 
 
 		 497 aa  601  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  53.36 
 
 		 499 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  53.36 
 
 		 499 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  53.56 
 
 		 499 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  51.92 
 
 		 497 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  53.09 
 
 		 510 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  52.02 
 
 		 500 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  52.15 
 
 		 495 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  50.6 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  53.01 
 
 		 496 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  52.06 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  52.06 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  51.85 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  51.85 
 
 		 503 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  51.21 
 
 		 510 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  50.72 
 
 		 504 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  51.75 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  51.65 
 
 		 498 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  51.22 
 
 		 503 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  51.78 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  50.41 
 
 		 740 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  49.38 
 
 		 494 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  50.1 
 
 		 496 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  49.48 
 
 		 505 aa  508  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  51.03 
 
 		 503 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  49.29 
 
 		 509 aa  510  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  47.86 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  48.77 
 
 		 492 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  49.09 
 
 		 502 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  48.26 
 
 		 502 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  48.1 
 
 		 504 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  49.09 
 
 		 507 aa  490  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  48.78 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  48.26 
 
 		 505 aa  485  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  49 
 
 		 505 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  48.75 
 
 		 502 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  48.48 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  47.61 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  48.88 
 
 		 498 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  47.85 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  47.87 
 
 		 523 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  47.46 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  46.14 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  47.11 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  44.13 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  44.65 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  46.15 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  43.81 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  43.56 
 
 		 502 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  41.77 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  41.84 
 
 		 515 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  42.25 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  40.84 
 
 		 511 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  40.65 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  39.64 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  37.98 
 
 		 499 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.87 
 
 		 538 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.06 
 
 		 537 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  34.41 
 
 		 538 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.29 
 
 		 538 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.41 
 
 		 538 aa  290  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.29 
 
 		 538 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  34.22 
 
 		 538 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 529 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.46 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  35.05 
 
 		 532 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  35.76 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 		 502 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.18 
 
 		 517 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  34.33 
 
 		 506 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  34.36 
 
 		 522 aa  249  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 522 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  33.01 
 
 		 508 aa  246  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  31.64 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.66 
 
 		 526 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.62 
 
 		 498 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  33.84 
 
 		 527 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  35.11 
 
 		 508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 508 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  34.33 
 
 		 514 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 513 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  31.93 
 
 		 524 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 507 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.26 
 
 		 507 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  34.12 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  33.9 
 
 		 513 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 513 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  36.03 
 
 		 518 aa  227  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  32.65 
 
 		 537 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  32.76 
 
 		 507 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  31.07 
 
 		 524 aa  224  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  31.76 
 
 		 507 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  33.08 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  30.84 
 
 		 517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  28.38 
 
 		 505 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  28.38 
 
 		 508 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  31.26 
 
 		 507 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>