125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1841 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  100 
 
 
481 aa  948    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  39.8 
 
 
505 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  37.76 
 
 
506 aa  296  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  37.4 
 
 
501 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  38.66 
 
 
510 aa  286  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  36.99 
 
 
501 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  37.63 
 
 
511 aa  280  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  39.04 
 
 
503 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  34.55 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  33.2 
 
 
510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  37.35 
 
 
518 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33.75 
 
 
515 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  33.54 
 
 
498 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  33.74 
 
 
740 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  34.15 
 
 
496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  34.2 
 
 
512 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  36.64 
 
 
504 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.04 
 
 
494 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  34.48 
 
 
509 aa  266  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  37.45 
 
 
497 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33 
 
 
499 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  36.57 
 
 
497 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.69 
 
 
495 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  31.9 
 
 
496 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  32.59 
 
 
499 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  32.79 
 
 
499 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  31.43 
 
 
500 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  34.22 
 
 
505 aa  257  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  31.91 
 
 
498 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  34.5 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  35.29 
 
 
509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  30.69 
 
 
502 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  34.16 
 
 
507 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.31 
 
 
492 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  30.55 
 
 
503 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  29.7 
 
 
507 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  29.8 
 
 
511 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  30.55 
 
 
503 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  30.55 
 
 
503 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  33.67 
 
 
500 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  35.1 
 
 
504 aa  246  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  30.35 
 
 
503 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.64 
 
 
506 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  35.58 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  35.99 
 
 
501 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  31.17 
 
 
501 aa  242  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  33.2 
 
 
503 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  33.75 
 
 
497 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  28.69 
 
 
497 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  31.85 
 
 
496 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  33.94 
 
 
523 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  35.43 
 
 
502 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  32.02 
 
 
505 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  31.3 
 
 
504 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  30.22 
 
 
505 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  29.45 
 
 
503 aa  216  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  29.96 
 
 
502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  30.6 
 
 
497 aa  203  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  29.57 
 
 
538 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  28.6 
 
 
538 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  28.6 
 
 
538 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  29.32 
 
 
538 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  28.6 
 
 
538 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  29.13 
 
 
538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2363  tryptophan halogenase  32.26 
 
 
802 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2404  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
806 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  27.74 
 
 
499 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  28.88 
 
 
537 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  26.87 
 
 
508 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  30.84 
 
 
532 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  26.71 
 
 
508 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  27.73 
 
 
505 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  28.37 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  28.61 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  28.03 
 
 
513 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  25.54 
 
 
502 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  27.27 
 
 
506 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  31.63 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  26.56 
 
 
529 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  26.56 
 
 
529 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  29.55 
 
 
513 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  27.3 
 
 
498 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  29.3 
 
 
505 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  26.06 
 
 
514 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  25.47 
 
 
524 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  25.16 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  25.89 
 
 
527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  28.21 
 
 
524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  24.71 
 
 
508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  25.93 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  25.05 
 
 
499 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  25.28 
 
 
508 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  23.41 
 
 
508 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  25.05 
 
 
503 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  24.9 
 
 
501 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  24.9 
 
 
501 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  22.35 
 
 
537 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  24.3 
 
 
517 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  27.79 
 
 
525 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  23.98 
 
 
526 aa  103  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>