129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1094 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 515 aa  1063    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  47.97 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  45.92 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  46.01 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  45.12 
 
 		 510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  44.6 
 
 		 501 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  43.76 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  45.6 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  45.05 
 
 		 499 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  45.05 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  45.05 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  45.51 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  44.06 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  43.82 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  43.06 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  41.98 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  43.63 
 
 		 511 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  41.75 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  42.83 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  43 
 
 		 512 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  44.9 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  43.84 
 
 		 509 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  43.06 
 
 		 503 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  43.06 
 
 		 500 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  42.57 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  41.9 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  43.06 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  43.06 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  42.86 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  42.86 
 
 		 504 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  45.36 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  45.34 
 
 		 518 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  42.6 
 
 		 740 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  43.23 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  41.84 
 
 		 506 aa  415  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  43.43 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  43.57 
 
 		 501 aa  415  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  42.48 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  42.36 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  43.29 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  41.34 
 
 		 498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  42.24 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  41.34 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  41.1 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  40.72 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  42.97 
 
 		 497 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  41.09 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  40.56 
 
 		 503 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  40.82 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  40.35 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  40.77 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  40.12 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  40.24 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  41.73 
 
 		 502 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  40.85 
 
 		 502 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  42.01 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  38.41 
 
 		 504 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  36.47 
 
 		 499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  36.77 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  36.51 
 
 		 506 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  40.09 
 
 		 522 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  33.75 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  37.18 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  32.52 
 
 		 538 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 529 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  37.27 
 
 		 524 aa  257  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 538 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 538 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  32.16 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  35.86 
 
 		 513 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  31.96 
 
 		 538 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  35.86 
 
 		 513 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  36.65 
 
 		 524 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  31.96 
 
 		 538 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.83 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.43 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.76 
 
 		 508 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  33.72 
 
 		 537 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  34.27 
 
 		 501 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  35.55 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  34.43 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  34.27 
 
 		 501 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  34.21 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  36.73 
 
 		 524 aa  243  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  33.07 
 
 		 508 aa  242  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  33.93 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 543 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  35.01 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  33 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  34.46 
 
 		 522 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.33 
 
 		 517 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  33.67 
 
 		 543 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  36.76 
 
 		 505 aa  237  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  35.86 
 
 		 514 aa  236  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  35.19 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  35.89 
 
 		 537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  34.78 
 
 		 513 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 543 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  32.79 
 
 		 525 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>