125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1124 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  69.52 
 
 
528 aa  789    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  96.5 
 
 
543 aa  1103    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  72.9 
 
 
525 aa  824    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  100 
 
 
543 aa  1139    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  98.16 
 
 
543 aa  1120    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  96.87 
 
 
543 aa  1111    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  52.35 
 
 
514 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  50 
 
 
520 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  49.72 
 
 
524 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  48.98 
 
 
517 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  47.49 
 
 
524 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  46.95 
 
 
522 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  48.04 
 
 
526 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  47.47 
 
 
514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  45.67 
 
 
537 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  45.72 
 
 
517 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  45.57 
 
 
520 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  46.14 
 
 
508 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  45.96 
 
 
531 aa  472  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  45.68 
 
 
505 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  43.18 
 
 
518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  43.86 
 
 
527 aa  445  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  41.47 
 
 
524 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  41.37 
 
 
513 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  39.02 
 
 
513 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  39.02 
 
 
513 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  38.65 
 
 
513 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  40.11 
 
 
524 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  38.62 
 
 
522 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  39.85 
 
 
507 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  38.4 
 
 
532 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  38.43 
 
 
507 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  37.06 
 
 
508 aa  359  6e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  37.17 
 
 
508 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  36.9 
 
 
508 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  37.31 
 
 
507 aa  350  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  37.4 
 
 
507 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  35.88 
 
 
507 aa  339  7e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  35.61 
 
 
515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  35.92 
 
 
510 aa  333  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  36.16 
 
 
511 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  35.47 
 
 
537 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  33.96 
 
 
501 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  33.61 
 
 
501 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.34 
 
 
498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.93 
 
 
517 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
499 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33 
 
 
515 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.85 
 
 
499 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.31 
 
 
508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  31.51 
 
 
504 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  32.42 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.12 
 
 
508 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.79 
 
 
497 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  31.92 
 
 
492 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.11 
 
 
505 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  33.79 
 
 
509 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  29.7 
 
 
503 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 
502 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  31.59 
 
 
501 aa  226  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  32.82 
 
 
507 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  29.24 
 
 
538 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  30.41 
 
 
511 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  29.27 
 
 
529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  29.06 
 
 
529 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  30.47 
 
 
497 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  30.02 
 
 
496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  30.49 
 
 
509 aa  217  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.68 
 
 
505 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  31.72 
 
 
502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  29.24 
 
 
496 aa  214  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  33.67 
 
 
518 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  32.21 
 
 
502 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  28.39 
 
 
538 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  28.26 
 
 
538 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.63 
 
 
506 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  28.26 
 
 
538 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  29.02 
 
 
506 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  30.45 
 
 
523 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  28.34 
 
 
538 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  30.94 
 
 
501 aa  206  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  30.91 
 
 
494 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  31.38 
 
 
497 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  28.15 
 
 
538 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  29.21 
 
 
510 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  31.2 
 
 
498 aa  204  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  30.48 
 
 
506 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  28.44 
 
 
503 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  28.44 
 
 
503 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  28.25 
 
 
503 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  28.25 
 
 
503 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  29.38 
 
 
537 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  30.74 
 
 
504 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  29.47 
 
 
740 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  28.21 
 
 
500 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  31.78 
 
 
501 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  30.33 
 
 
500 aa  200  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  31.72 
 
 
502 aa  200  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  31.58 
 
 
503 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>