128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1121 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  60.04 
 
 
494 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  59.55 
 
 
496 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  80.2 
 
 
500 aa  867    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  64.34 
 
 
740 aa  698    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  61.99 
 
 
496 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  63.93 
 
 
498 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  99.8 
 
 
503 aa  1053    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  64.48 
 
 
492 aa  682    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  83.54 
 
 
495 aa  891    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  100 
 
 
503 aa  1054    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  99.6 
 
 
503 aa  1051    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  99.6 
 
 
503 aa  1051    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  58.61 
 
 
510 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  57.84 
 
 
505 aa  624  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  58.08 
 
 
503 aa  623  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  56.67 
 
 
523 aa  600  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  55.94 
 
 
497 aa  587  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  51.52 
 
 
502 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
499 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
499 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  52.06 
 
 
506 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
499 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  49.7 
 
 
510 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  49.9 
 
 
504 aa  527  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  48.58 
 
 
496 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  51.21 
 
 
497 aa  518  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  49.07 
 
 
497 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  47.62 
 
 
509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  48.28 
 
 
500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  50.3 
 
 
498 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  50.4 
 
 
503 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  48.89 
 
 
509 aa  508  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  48.7 
 
 
506 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  48.96 
 
 
497 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  48.91 
 
 
507 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  47.41 
 
 
502 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  48.39 
 
 
501 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  47.06 
 
 
504 aa  500  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  48.79 
 
 
497 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  46.26 
 
 
505 aa  478  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  45.78 
 
 
505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  46.15 
 
 
501 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  45.36 
 
 
502 aa  465  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  47.9 
 
 
505 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  45.19 
 
 
502 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  44.09 
 
 
512 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  43.78 
 
 
507 aa  445  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  44.69 
 
 
501 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  45.98 
 
 
518 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  45.22 
 
 
511 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  44.04 
 
 
503 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  43.03 
 
 
511 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  43.06 
 
 
515 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  42.25 
 
 
505 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  42.43 
 
 
504 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  41.57 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  41.78 
 
 
501 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  38.79 
 
 
499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.63 
 
 
538 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.45 
 
 
538 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  36.02 
 
 
538 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  35.63 
 
 
538 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.25 
 
 
538 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  35.06 
 
 
538 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.38 
 
 
537 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.75 
 
 
529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.24 
 
 
529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  35.19 
 
 
502 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  35.91 
 
 
506 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.03 
 
 
517 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  30.55 
 
 
481 aa  246  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.22 
 
 
505 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.75 
 
 
508 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.96 
 
 
508 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33 
 
 
532 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  35.55 
 
 
524 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
522 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
514 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  37.86 
 
 
508 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  32.95 
 
 
527 aa  229  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
510 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  32.41 
 
 
508 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  32.06 
 
 
513 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.91 
 
 
498 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  34.18 
 
 
526 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  33.62 
 
 
507 aa  226  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  31.14 
 
 
514 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  30.89 
 
 
524 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
524 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  35.37 
 
 
511 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  30.93 
 
 
507 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  32.49 
 
 
508 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
513 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
513 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
513 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  30.78 
 
 
508 aa  216  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  30.6 
 
 
503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  33.55 
 
 
515 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  33.6 
 
 
531 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  31.56 
 
 
501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>