128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1853 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  100 
 
 
497 aa  1025    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  59.84 
 
 
510 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  58.01 
 
 
498 aa  616  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  55.53 
 
 
494 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  56.15 
 
 
503 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  55.94 
 
 
503 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  55.94 
 
 
503 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  55.94 
 
 
503 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  55.1 
 
 
495 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  53.67 
 
 
496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  54.9 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  57.64 
 
 
523 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  55.65 
 
 
497 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  53.43 
 
 
500 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  53.56 
 
 
492 aa  565  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  55.37 
 
 
503 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  54.83 
 
 
740 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  54.16 
 
 
505 aa  557  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  51.75 
 
 
506 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  51.2 
 
 
504 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  52.74 
 
 
503 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  48.47 
 
 
497 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  48.88 
 
 
499 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  49.5 
 
 
509 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  46.15 
 
 
507 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  48.88 
 
 
499 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  47.61 
 
 
502 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  48.68 
 
 
499 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  46.67 
 
 
502 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  49.6 
 
 
501 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  48.71 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  49.2 
 
 
506 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  48.6 
 
 
501 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  47.14 
 
 
496 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  51.29 
 
 
505 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  49.7 
 
 
504 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  48.28 
 
 
498 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  47.86 
 
 
509 aa  478  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  47.78 
 
 
507 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  45.66 
 
 
500 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  48.09 
 
 
497 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  47.74 
 
 
502 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  46.53 
 
 
497 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  46.87 
 
 
505 aa  455  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  47.08 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  45.04 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  45.6 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  46.53 
 
 
511 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  45.75 
 
 
501 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  43.6 
 
 
502 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  43.35 
 
 
504 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  39.8 
 
 
511 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  41 
 
 
503 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  41.46 
 
 
505 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  40.35 
 
 
515 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  42.45 
 
 
501 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  42.04 
 
 
501 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  37.18 
 
 
499 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  37.25 
 
 
522 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  34.9 
 
 
532 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  37.24 
 
 
538 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  37.24 
 
 
538 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  37.47 
 
 
538 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  37.24 
 
 
538 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  36.57 
 
 
481 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.11 
 
 
505 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.11 
 
 
508 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  34.51 
 
 
524 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  37.36 
 
 
538 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  34.3 
 
 
508 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  36.32 
 
 
529 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  34.5 
 
 
513 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  36.32 
 
 
529 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  34.5 
 
 
513 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.87 
 
 
517 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  36.9 
 
 
538 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  34.31 
 
 
513 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  36.62 
 
 
537 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  35.66 
 
 
508 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.67 
 
 
524 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  34.51 
 
 
507 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  35.11 
 
 
510 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  34.77 
 
 
507 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  34.1 
 
 
513 aa  242  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.65 
 
 
511 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  36.36 
 
 
507 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.27 
 
 
502 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  32.69 
 
 
524 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  33.52 
 
 
537 aa  240  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.07 
 
 
526 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  34.52 
 
 
508 aa  237  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  31.68 
 
 
507 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  32.08 
 
 
498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  34.78 
 
 
505 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  30.86 
 
 
525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
517 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  35.96 
 
 
508 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  33.08 
 
 
522 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  33.46 
 
 
507 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  36.36 
 
 
514 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>