125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02802 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  59.48 
 
 
498 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  100 
 
 
523 aa  1071    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  57.43 
 
 
495 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  56.56 
 
 
496 aa  611  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  59.18 
 
 
505 aa  610  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  57.06 
 
 
503 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  56.85 
 
 
503 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  56.85 
 
 
503 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  56.85 
 
 
503 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  56.97 
 
 
740 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  55.58 
 
 
500 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  57.85 
 
 
503 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  57.81 
 
 
497 aa  576  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  54.67 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  55.98 
 
 
496 aa  570  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  53.89 
 
 
494 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  54.69 
 
 
492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  49.41 
 
 
510 aa  502  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  49.28 
 
 
497 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  48.89 
 
 
502 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  50.31 
 
 
497 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  47.96 
 
 
496 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  51.73 
 
 
504 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  49.29 
 
 
504 aa  487  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  47.87 
 
 
506 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  49.69 
 
 
509 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  48.72 
 
 
506 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  49.3 
 
 
509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  48.07 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  48.27 
 
 
499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  48.27 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  48.48 
 
 
501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  44.47 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  50.51 
 
 
503 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  44.55 
 
 
507 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  47.28 
 
 
505 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  47.14 
 
 
497 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  46.98 
 
 
501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  48.13 
 
 
497 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  46.77 
 
 
498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  44.18 
 
 
500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  47.64 
 
 
502 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  47.26 
 
 
507 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  48.3 
 
 
505 aa  435  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  47.74 
 
 
511 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  46.53 
 
 
518 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  44.36 
 
 
505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  39.64 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  41.28 
 
 
502 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  42.38 
 
 
512 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  40.24 
 
 
515 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  41.87 
 
 
501 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  45.17 
 
 
501 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  43.88 
 
 
501 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  40.08 
 
 
503 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  40.36 
 
 
504 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  37.5 
 
 
505 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  37.88 
 
 
499 aa  320  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  33.2 
 
 
538 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  33.2 
 
 
538 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  33.4 
 
 
538 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  32.56 
 
 
538 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  31.35 
 
 
538 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  31.35 
 
 
538 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  32.82 
 
 
537 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  34.72 
 
 
532 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.47 
 
 
502 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  35.71 
 
 
513 aa  239  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
507 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  35.85 
 
 
527 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.59 
 
 
526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  34.97 
 
 
522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  31.54 
 
 
517 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  30.94 
 
 
506 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  33.94 
 
 
481 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  32.55 
 
 
513 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.55 
 
 
513 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.67 
 
 
508 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.07 
 
 
508 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  32.61 
 
 
513 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  31.91 
 
 
529 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  31.91 
 
 
529 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  32.08 
 
 
507 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  34.83 
 
 
524 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.09 
 
 
508 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  35.02 
 
 
508 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  30.77 
 
 
528 aa  223  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  30.04 
 
 
514 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  32.3 
 
 
524 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  33.69 
 
 
511 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  31.59 
 
 
522 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  32.54 
 
 
507 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  34.04 
 
 
514 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  33.77 
 
 
510 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  31.68 
 
 
507 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  29.42 
 
 
507 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.59 
 
 
508 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  31.02 
 
 
537 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.2 
 
 
505 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.78 
 
 
508 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>