142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1104 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  64.34 
 
 		 503 aa  698    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  100 
 
 		 740 aa  1543    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  61.6 
 
 		 498 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  62.22 
 
 		 492 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  64.81 
 
 		 495 aa  695    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  64.34 
 
 		 503 aa  698    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  63.95 
 
 		 500 aa  697    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  64.14 
 
 		 503 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  64.14 
 
 		 503 aa  697    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  59.67 
 
 		 510 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  58.85 
 
 		 494 aa  619  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  58.9 
 
 		 496 aa  619  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  58.44 
 
 		 496 aa  608  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  56.88 
 
 		 523 aa  585  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  53.81 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  53.93 
 
 		 503 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  54.83 
 
 		 497 aa  560  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  50.71 
 
 		 502 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  50.52 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  50 
 
 		 504 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  50.41 
 
 		 506 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  49.18 
 
 		 496 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  48.79 
 
 		 500 aa  508  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  48.31 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  48.31 
 
 		 499 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  49.69 
 
 		 497 aa  505  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  48.11 
 
 		 499 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  46.83 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  47.37 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  48.24 
 
 		 497 aa  492  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  49.9 
 
 		 498 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  47.27 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  49.29 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  47.77 
 
 		 505 aa  482  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  46.83 
 
 		 507 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  45.95 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  47.08 
 
 		 506 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  47.05 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  47.27 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  46.12 
 
 		 497 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  44.96 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  47.17 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  45.73 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  47.27 
 
 		 501 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  45.45 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  44.09 
 
 		 509 aa  448  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  46.48 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  44.53 
 
 		 505 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  43.78 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  45.34 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  41.96 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  42.35 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  42.6 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  42.66 
 
 		 504 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  41.16 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  42.7 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  42.5 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  44.93 
 
 		 499 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  36.33 
 
 		 538 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  36.9 
 
 		 538 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  36.9 
 
 		 538 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  36.9 
 
 		 538 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  36.12 
 
 		 538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  35.73 
 
 		 538 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  36.95 
 
 		 537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  33.74 
 
 		 481 aa  271  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.86 
 
 		 529 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.86 
 
 		 529 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.4 
 
 		 502 aa  257  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  36.49 
 
 		 505 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 508 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 508 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 506 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  34.38 
 
 		 508 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  35.96 
 
 		 532 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.19 
 
 		 517 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.76 
 
 		 498 aa  236  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  37.13 
 
 		 508 aa  234  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.89 
 
 		 507 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  35.42 
 
 		 522 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  32.62 
 
 		 507 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.5 
 
 		 508 aa  232  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  34.81 
 
 		 526 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  35.81 
 
 		 513 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  35.81 
 
 		 513 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  35.81 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 499 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 503 aa  227  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 515 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  31.2 
 
 		 507 aa  225  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  33.05 
 
 		 501 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 501 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  35.47 
 
 		 527 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  32.21 
 
 		 507 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  32.36 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  32.24 
 
 		 507 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  34.25 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 524 aa  220  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  36.05 
 
 		 518 aa  220  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.07 
 
 		 508 aa  220  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>