135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2301 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  66.4 
 
 
497 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  100 
 
 
499 aa  1040    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  68.8 
 
 
507 aa  736    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  97.8 
 
 
499 aa  1024    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  98.2 
 
 
499 aa  1024    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  56.25 
 
 
502 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  53.43 
 
 
500 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  53.36 
 
 
506 aa  561  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  52.75 
 
 
496 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  50.6 
 
 
500 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  51.92 
 
 
504 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  51.93 
 
 
498 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  51.53 
 
 
505 aa  535  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
502 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  50.3 
 
 
495 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
503 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
503 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
503 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  53.33 
 
 
496 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  51.62 
 
 
509 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  50.51 
 
 
503 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  51.2 
 
 
496 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  50.51 
 
 
494 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  50.92 
 
 
503 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  48.98 
 
 
510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  51.94 
 
 
503 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  50.51 
 
 
497 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  48.31 
 
 
740 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  48.69 
 
 
497 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  49.09 
 
 
498 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  48.99 
 
 
509 aa  498  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  48.88 
 
 
497 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  47.7 
 
 
510 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  48.17 
 
 
505 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  49.9 
 
 
505 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  48.48 
 
 
504 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  47.77 
 
 
501 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  47.87 
 
 
506 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  47.56 
 
 
501 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  47.46 
 
 
505 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  46.87 
 
 
492 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  47.27 
 
 
507 aa  478  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  48.07 
 
 
523 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  47.11 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  46.56 
 
 
512 aa  458  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  45.49 
 
 
497 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  45.67 
 
 
518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  46.77 
 
 
511 aa  445  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  45.05 
 
 
515 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  43.89 
 
 
503 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  43.91 
 
 
511 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  44.02 
 
 
502 aa  435  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  44.38 
 
 
501 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  43.63 
 
 
501 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  43.71 
 
 
501 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  42.54 
 
 
505 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  41.9 
 
 
504 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  38.92 
 
 
499 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  36.12 
 
 
538 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.93 
 
 
538 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  35.48 
 
 
538 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  38.3 
 
 
538 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  38.3 
 
 
538 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  38.3 
 
 
538 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  35.63 
 
 
522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  36.31 
 
 
537 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  35.73 
 
 
517 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  35.99 
 
 
529 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  35.99 
 
 
529 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  37.61 
 
 
508 aa  260  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  32.59 
 
 
481 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.45 
 
 
502 aa  257  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  34.82 
 
 
532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  36.53 
 
 
524 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  34.06 
 
 
499 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  37.95 
 
 
526 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.87 
 
 
498 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  34.89 
 
 
507 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  35.36 
 
 
517 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  33.9 
 
 
514 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  33.73 
 
 
501 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  33.2 
 
 
513 aa  246  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.3 
 
 
507 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.8 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  35.77 
 
 
508 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  33.2 
 
 
503 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  34.1 
 
 
524 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  34.87 
 
 
508 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  33.89 
 
 
537 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  33.33 
 
 
522 aa  243  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  31.53 
 
 
506 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.47 
 
 
514 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  33.46 
 
 
505 aa  240  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  33.67 
 
 
524 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
508 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  35.82 
 
 
518 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.99 
 
 
505 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.99 
 
 
508 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
543 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  33.78 
 
 
507 aa  236  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>