125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3278 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  100 
 
 
518 aa  1053    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  51.81 
 
 
509 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  57.89 
 
 
501 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  52.72 
 
 
505 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  52.69 
 
 
509 aa  521  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  53.67 
 
 
506 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  54.18 
 
 
503 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  52.76 
 
 
510 aa  514  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  57.33 
 
 
511 aa  508  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  49.9 
 
 
501 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  51.33 
 
 
504 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  52.33 
 
 
505 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  48.48 
 
 
506 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  50.62 
 
 
505 aa  478  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  47.53 
 
 
496 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  45.71 
 
 
502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  48.68 
 
 
507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  50 
 
 
497 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  48.55 
 
 
504 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  43.91 
 
 
498 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  46.06 
 
 
497 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  46.91 
 
 
500 aa  458  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  46.95 
 
 
496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  45.67 
 
 
499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  47.08 
 
 
497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  47.65 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  44.73 
 
 
500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  48.67 
 
 
502 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  46.03 
 
 
495 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  44.14 
 
 
507 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  45.47 
 
 
499 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  48.06 
 
 
501 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  43.26 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  45.98 
 
 
503 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  45.84 
 
 
498 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  47.17 
 
 
503 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  44.42 
 
 
492 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  45.98 
 
 
503 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  45.77 
 
 
503 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  45.07 
 
 
499 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  42.74 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  44.87 
 
 
505 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  43.37 
 
 
510 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  44.04 
 
 
497 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  45.77 
 
 
503 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  44.65 
 
 
502 aa  435  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  45.34 
 
 
740 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  41.5 
 
 
502 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  44.49 
 
 
512 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  45.34 
 
 
515 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  45.75 
 
 
497 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  39.92 
 
 
503 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  47.31 
 
 
523 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  46.02 
 
 
501 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  43.24 
 
 
504 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  40.62 
 
 
505 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  40.64 
 
 
511 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  38.65 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  39.31 
 
 
538 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  39.54 
 
 
538 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  39.31 
 
 
538 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  38.94 
 
 
538 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  39.77 
 
 
538 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  38.48 
 
 
538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  37.35 
 
 
481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  38.62 
 
 
537 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  35.73 
 
 
529 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  35.73 
 
 
529 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  38.18 
 
 
524 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  36.22 
 
 
532 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  37.14 
 
 
522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  35.93 
 
 
499 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33 
 
 
517 aa  246  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  35.78 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.47 
 
 
506 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  35.78 
 
 
501 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  35.41 
 
 
503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.19 
 
 
502 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.64 
 
 
508 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.41 
 
 
505 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  36.61 
 
 
513 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  34.41 
 
 
508 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  31.93 
 
 
508 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  32.61 
 
 
498 aa  223  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  32.35 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.35 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  33.27 
 
 
517 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  32.15 
 
 
513 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  38.83 
 
 
505 aa  217  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  32.14 
 
 
526 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  32.63 
 
 
522 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  33.53 
 
 
543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  32.45 
 
 
524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  33.67 
 
 
543 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  35.18 
 
 
527 aa  213  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  32.77 
 
 
531 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  32.65 
 
 
525 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  30.66 
 
 
518 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  31.69 
 
 
508 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>