127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1607 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  100 
 
 		 505 aa  1043    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  74.59 
 
 		 503 aa  776    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  59.55 
 
 		 496 aa  628  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  57.84 
 
 		 503 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  57.43 
 
 		 503 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  57.64 
 
 		 503 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  57.43 
 
 		 503 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  59.38 
 
 		 523 aa  610  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  54.67 
 
 		 500 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  55.24 
 
 		 498 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  55.24 
 
 		 495 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  54.92 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  53.18 
 
 		 494 aa  582  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  53.39 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  53.81 
 
 		 740 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  53.4 
 
 		 492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  54.16 
 
 		 497 aa  557  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  51.53 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  51.73 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  51.53 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  48.28 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  49.8 
 
 		 504 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  50.93 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  50.61 
 
 		 497 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  48.9 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  49.48 
 
 		 506 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  49.5 
 
 		 509 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  47.7 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  52.02 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 502 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  50 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  49.49 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  48.76 
 
 		 497 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  48.39 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  46.15 
 
 		 500 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  44.18 
 
 		 502 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  48.79 
 
 		 503 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  48.07 
 
 		 501 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  48.61 
 
 		 505 aa  471  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  49.6 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  46.23 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  48.48 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  46.42 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  45.4 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  48.6 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  46.63 
 
 		 511 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  44.87 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  44.13 
 
 		 512 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  42.48 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  40.67 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  41.72 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  42.37 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  42.42 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  42.63 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  42.63 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  40.12 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  38.51 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  37.37 
 
 		 499 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  33.14 
 
 		 538 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.87 
 
 		 502 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  33.07 
 
 		 538 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  32.94 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 538 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 538 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.44 
 
 		 529 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.64 
 
 		 529 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  37.38 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  32.88 
 
 		 537 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  37.76 
 
 		 524 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  34.35 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  34.87 
 
 		 532 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.53 
 
 		 506 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 524 aa  232  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  33.98 
 
 		 513 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.25 
 
 		 508 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  32.02 
 
 		 481 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  30.53 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.66 
 
 		 508 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  30.53 
 
 		 508 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  30.14 
 
 		 508 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 517 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.06 
 
 		 513 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  32.06 
 
 		 513 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  35.42 
 
 		 514 aa  220  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  31.87 
 
 		 507 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  30.69 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  31.85 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 508 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  31.87 
 
 		 508 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 505 aa  217  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  34.18 
 
 		 527 aa  216  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  32.33 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  30.49 
 
 		 515 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  32.17 
 
 		 507 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  32.1 
 
 		 522 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  33.07 
 
 		 524 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.86 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>