133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4726 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  92.75 
 
 		 538 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  91.62 
 
 		 537 aa  1006    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  91.64 
 
 		 538 aa  1033    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  100 
 
 		 538 aa  1123    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  98.88 
 
 		 538 aa  1113    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  58.03 
 
 		 529 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  92.57 
 
 		 538 aa  1045    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  92.94 
 
 		 538 aa  1049    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  57.83 
 
 		 529 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  36.12 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  34.98 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  36.59 
 
 		 510 aa  303  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  40.42 
 
 		 501 aa  302  8.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  35.78 
 
 		 504 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  35.15 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  37.45 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  36.87 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  39.03 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  35.25 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  35.25 
 
 		 503 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  35 
 
 		 495 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  34.94 
 
 		 505 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  35.06 
 
 		 503 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  35.06 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  34.29 
 
 		 506 aa  289  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  35.14 
 
 		 507 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  36.03 
 
 		 502 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  34.75 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.29 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  34.56 
 
 		 510 aa  287  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  36.5 
 
 		 499 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  36.62 
 
 		 502 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  34.55 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  36.12 
 
 		 740 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  35.63 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  36.12 
 
 		 499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  35.92 
 
 		 504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  37.56 
 
 		 497 aa  282  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  35.93 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  35.38 
 
 		 511 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.8 
 
 		 498 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  35.91 
 
 		 497 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  35.88 
 
 		 501 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  34.15 
 
 		 524 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  38.52 
 
 		 494 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  38.94 
 
 		 518 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  37.1 
 
 		 497 aa  276  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  34.04 
 
 		 506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  33.71 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  35.25 
 
 		 504 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.89 
 
 		 502 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  34.16 
 
 		 511 aa  272  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  33.71 
 
 		 507 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  35.28 
 
 		 532 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  35.11 
 
 		 498 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  33.9 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  39.95 
 
 		 503 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  36.17 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  33.91 
 
 		 513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  33.91 
 
 		 513 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  34.56 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.44 
 
 		 517 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  30.36 
 
 		 524 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  37.12 
 
 		 503 aa  264  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.72 
 
 		 522 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  36.48 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 498 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  34.54 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 503 aa  259  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  33.02 
 
 		 508 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  35.91 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.97 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  36.9 
 
 		 497 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  37.44 
 
 		 507 aa  256  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  32.69 
 
 		 508 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  32.13 
 
 		 518 aa  256  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  36.49 
 
 		 502 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  34.48 
 
 		 507 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  32.49 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  35.49 
 
 		 505 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  31.35 
 
 		 523 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  30.71 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  37.65 
 
 		 497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  33.48 
 
 		 507 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 517 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  31.7 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  32.83 
 
 		 515 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  33.98 
 
 		 507 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.29 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  31.75 
 
 		 527 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  30.17 
 
 		 524 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.29 
 
 		 508 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.49 
 
 		 508 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.1 
 
 		 526 aa  233  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.48 
 
 		 511 aa  233  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  31.52 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  30.85 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.8 
 
 		 508 aa  232  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  30.48 
 
 		 503 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>