126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1262 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  100 
 
 		 524 aa  1095    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  58.57 
 
 		 526 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  61.63 
 
 		 517 aa  687    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  59.54 
 
 		 522 aa  654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  60 
 
 		 524 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  58.14 
 
 		 514 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  55.31 
 
 		 537 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  53.92 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  53.79 
 
 		 508 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  52.07 
 
 		 531 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  50.48 
 
 		 528 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  50 
 
 		 525 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  48.46 
 
 		 520 aa  537  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  47.79 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  47.06 
 
 		 543 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  47.24 
 
 		 543 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  47.06 
 
 		 543 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  45.16 
 
 		 517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  48.43 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  48.93 
 
 		 527 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  47.95 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  46.53 
 
 		 524 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  46.08 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  45.19 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  45 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  44.81 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  44.27 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  43.13 
 
 		 507 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  41.36 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  44.89 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  44.77 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  43.74 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  43.91 
 
 		 508 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  40.81 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  42.23 
 
 		 532 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  42.64 
 
 		 522 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  38.98 
 
 		 507 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  37.01 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  37.8 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  36.99 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  37.67 
 
 		 510 aa  365  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  34.01 
 
 		 537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.23 
 
 		 508 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  35.1 
 
 		 498 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  35.17 
 
 		 505 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  31.46 
 
 		 529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  31.27 
 
 		 529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  37.47 
 
 		 501 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.08 
 
 		 501 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  36.96 
 
 		 515 aa  243  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  31.86 
 
 		 501 aa  236  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  36.84 
 
 		 509 aa  236  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  30.25 
 
 		 538 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.12 
 
 		 502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  30.25 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  30.93 
 
 		 538 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.81 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  34.16 
 
 		 511 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  31.97 
 
 		 504 aa  230  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  32.64 
 
 		 504 aa  229  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.18 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 497 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  34.7 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  29.64 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  32.56 
 
 		 499 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  34.83 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 496 aa  227  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 499 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.14 
 
 		 506 aa  226  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  32.56 
 
 		 499 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  32.3 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  29.49 
 
 		 538 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  29.49 
 
 		 538 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  29.49 
 
 		 538 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  31.71 
 
 		 503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.31 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  32.95 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  34.29 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  31.35 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  34.86 
 
 		 504 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  31 
 
 		 537 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  35.17 
 
 		 507 aa  220  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  32.82 
 
 		 506 aa  220  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  32.77 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 497 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.01 
 
 		 495 aa  216  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  30.66 
 
 		 505 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  31.31 
 
 		 500 aa  216  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  32.57 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  34.76 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  33.41 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  31.4 
 
 		 740 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  33.04 
 
 		 505 aa  213  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.88 
 
 		 506 aa  213  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 497 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  30.29 
 
 		 523 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  30.54 
 
 		 503 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>