128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1143 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  68.75 
 
 		 525 aa  760    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  69.52 
 
 		 543 aa  789    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  69.33 
 
 		 543 aa  788    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  100 
 
 		 528 aa  1103    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  69.14 
 
 		 543 aa  784    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  68.96 
 
 		 543 aa  780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  51.61 
 
 		 514 aa  553  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  50.93 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  50.48 
 
 		 524 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  50.57 
 
 		 526 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  49.43 
 
 		 517 aa  538  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 520 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  47.81 
 
 		 522 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  46.2 
 
 		 537 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  47.83 
 
 		 514 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  45.27 
 
 		 520 aa  498  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  45.87 
 
 		 508 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  45.98 
 
 		 531 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  43.69 
 
 		 517 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  45.51 
 
 		 527 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  44.11 
 
 		 524 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  45.37 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  43.98 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  40 
 
 		 513 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  39.81 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  40.23 
 
 		 513 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  41.31 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  39.62 
 
 		 507 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  39.28 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  38.78 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  39.16 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  37.28 
 
 		 508 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  38.12 
 
 		 522 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  39.5 
 
 		 507 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  37.33 
 
 		 515 aa  360  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  36.94 
 
 		 507 aa  359  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  37.63 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  37.21 
 
 		 508 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  36.95 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  35.19 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  35.09 
 
 		 537 aa  329  7e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.81 
 
 		 511 aa  329  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.52 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.2 
 
 		 498 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  30.89 
 
 		 504 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  29.24 
 
 		 529 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  29.05 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  33.56 
 
 		 501 aa  236  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  27.22 
 
 		 538 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  29.43 
 
 		 509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  27.12 
 
 		 538 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  32.66 
 
 		 501 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  27.12 
 
 		 538 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  27.12 
 
 		 538 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.57 
 
 		 508 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.19 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.14 
 
 		 505 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  31.49 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  32.51 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33.4 
 
 		 515 aa  226  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  31.42 
 
 		 511 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.22 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 499 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  32.32 
 
 		 502 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  30.77 
 
 		 523 aa  223  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  32.62 
 
 		 499 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  27.09 
 
 		 538 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 505 aa  223  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 499 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  30.51 
 
 		 496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  30.58 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  27.17 
 
 		 538 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  32.24 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  30.54 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  30.09 
 
 		 497 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  31.45 
 
 		 506 aa  216  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  31.93 
 
 		 507 aa  216  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  27.12 
 
 		 537 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  30.56 
 
 		 504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  30.12 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  31.82 
 
 		 511 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  29.85 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  31.2 
 
 		 510 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  30.45 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 499 aa  210  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  31.94 
 
 		 501 aa  209  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  28.65 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  30.19 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  30.06 
 
 		 500 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  31.48 
 
 		 518 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  31.32 
 
 		 503 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  28.2 
 
 		 510 aa  203  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  30.25 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  31.24 
 
 		 501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  31.81 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  28.22 
 
 		 496 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  31.37 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  29.57 
 
 		 504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  29.86 
 
 		 740 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>