127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2144 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  100 
 
 
504 aa  1048    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  50 
 
 
502 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  47 
 
 
503 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  45.25 
 
 
503 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  44.29 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  42.54 
 
 
501 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  44.15 
 
 
501 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  43.11 
 
 
500 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  44.47 
 
 
502 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  44.47 
 
 
510 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  42.23 
 
 
503 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  42.37 
 
 
510 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  43.09 
 
 
504 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  42.43 
 
 
503 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  42.03 
 
 
503 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  42.23 
 
 
503 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  43.43 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  43.71 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  43.24 
 
 
518 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  42.57 
 
 
494 aa  415  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  43.5 
 
 
497 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  42.65 
 
 
509 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  42.31 
 
 
505 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  43.06 
 
 
505 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  43.35 
 
 
497 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  43.43 
 
 
500 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  42.66 
 
 
740 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  44.91 
 
 
511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  42.08 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  41.58 
 
 
496 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  43.09 
 
 
504 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  40.65 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  42.42 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  40.73 
 
 
497 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  42.48 
 
 
503 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  41.99 
 
 
498 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  40.85 
 
 
498 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  41.99 
 
 
492 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  43.3 
 
 
497 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  41.9 
 
 
499 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  39.4 
 
 
496 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  41.9 
 
 
499 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  42.11 
 
 
499 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  38.45 
 
 
505 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  38.54 
 
 
511 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  41.82 
 
 
496 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  40.4 
 
 
505 aa  392  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  41.6 
 
 
507 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  39.48 
 
 
512 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  39.4 
 
 
507 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  37.5 
 
 
502 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  41.56 
 
 
502 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  40.08 
 
 
523 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  40.61 
 
 
501 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  38.99 
 
 
501 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  38.41 
 
 
515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  40.2 
 
 
497 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  37.53 
 
 
499 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  36.11 
 
 
538 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  36.07 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.92 
 
 
538 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.48 
 
 
538 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.48 
 
 
538 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  35.48 
 
 
538 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.36 
 
 
537 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.91 
 
 
529 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.91 
 
 
529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
505 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.06 
 
 
508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  32.06 
 
 
527 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  35.22 
 
 
526 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  30.74 
 
 
502 aa  250  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.13 
 
 
506 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.14 
 
 
522 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.88 
 
 
508 aa  247  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33.9 
 
 
532 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  32.29 
 
 
514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
524 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  32.99 
 
 
498 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  35.88 
 
 
507 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  30.89 
 
 
528 aa  240  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  34.33 
 
 
520 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  35.12 
 
 
524 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  32.95 
 
 
514 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  31.51 
 
 
543 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  31.33 
 
 
543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  32.19 
 
 
522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  31 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  35.88 
 
 
513 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  30.91 
 
 
543 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  31.09 
 
 
543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  36.32 
 
 
513 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  31.08 
 
 
501 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  36.32 
 
 
513 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  30.83 
 
 
507 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.05 
 
 
517 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  32.28 
 
 
508 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  31.69 
 
 
525 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  32.48 
 
 
507 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>