127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3700 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  59.84 
 
 		 503 aa  648    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  100 
 
 		 494 aa  1033    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  61.59 
 
 		 496 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  62.12 
 
 		 498 aa  652    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  70.47 
 
 		 510 aa  761    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  59.55 
 
 		 495 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  60.04 
 
 		 503 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  59.63 
 
 		 503 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  59.63 
 
 		 503 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  58.75 
 
 		 500 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  60.12 
 
 		 496 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  58.85 
 
 		 740 aa  619  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  55.53 
 
 		 497 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  56.12 
 
 		 492 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  53.18 
 
 		 505 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  54.34 
 
 		 503 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  52.99 
 
 		 497 aa  567  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  54.12 
 
 		 523 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  49.49 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  49.9 
 
 		 509 aa  531  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  50.91 
 
 		 499 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  50.91 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  50.51 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  49.3 
 
 		 504 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  51.31 
 
 		 497 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  49.7 
 
 		 502 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  49.38 
 
 		 506 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  47.82 
 
 		 507 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  47.19 
 
 		 510 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 497 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  47.7 
 
 		 502 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 503 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  46.87 
 
 		 500 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  47.58 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  46.36 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  49.2 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  47.47 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  45.69 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  44.69 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  47.88 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  45.56 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  44.74 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  44.92 
 
 		 507 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  47.4 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  46.08 
 
 		 503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  45.07 
 
 		 502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  46.2 
 
 		 505 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  44.91 
 
 		 502 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  43.86 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  42.74 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  44.2 
 
 		 511 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  41.75 
 
 		 515 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  44.49 
 
 		 511 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  43.9 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  42.11 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  41.9 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  42.57 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  39.4 
 
 		 499 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  39.44 
 
 		 538 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  38.52 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  39.21 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  39.44 
 
 		 538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 529 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 529 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  38.52 
 
 		 538 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  38.05 
 
 		 538 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  32.04 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  38.14 
 
 		 537 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  35.39 
 
 		 508 aa  253  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33.86 
 
 		 532 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.24 
 
 		 506 aa  250  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.93 
 
 		 517 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  32.44 
 
 		 524 aa  246  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  33.13 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  32.35 
 
 		 522 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.4 
 
 		 498 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 507 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  34.13 
 
 		 508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 508 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 508 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 505 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 508 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  35.13 
 
 		 507 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 513 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  33.4 
 
 		 507 aa  226  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  34.12 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 537 aa  226  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 527 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  32.38 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  31.65 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  32.54 
 
 		 507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  30.5 
 
 		 513 aa  219  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.03 
 
 		 501 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  30.81 
 
 		 526 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  29.69 
 
 		 522 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  30.73 
 
 		 520 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>