126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0182 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  100 
 
 
502 aa  1019    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  55.58 
 
 
500 aa  557  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  54.56 
 
 
504 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  54.6 
 
 
501 aa  531  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  53.45 
 
 
509 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  51.81 
 
 
510 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  52.74 
 
 
501 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  52.57 
 
 
504 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  52.14 
 
 
503 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  51.11 
 
 
506 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  48.98 
 
 
506 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  47.86 
 
 
502 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  50.22 
 
 
498 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  48.1 
 
 
507 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  48.99 
 
 
502 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  49.28 
 
 
492 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  47.43 
 
 
496 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  49.6 
 
 
505 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  48.68 
 
 
497 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  47.45 
 
 
499 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  53.03 
 
 
497 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  48.57 
 
 
496 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  52.79 
 
 
505 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  49.69 
 
 
503 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  46.31 
 
 
495 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  47.45 
 
 
499 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  46.61 
 
 
498 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  48.51 
 
 
509 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  51.53 
 
 
505 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  58.08 
 
 
511 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  47.25 
 
 
499 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  51.71 
 
 
505 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  45.47 
 
 
503 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  47.98 
 
 
497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  48.27 
 
 
507 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  45.47 
 
 
503 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  45.47 
 
 
503 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  45.27 
 
 
503 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  44.92 
 
 
500 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  46.41 
 
 
510 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  49.38 
 
 
518 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  45.73 
 
 
740 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  46.72 
 
 
497 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  44.69 
 
 
496 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  45.19 
 
 
494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  48.06 
 
 
523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  46.81 
 
 
512 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  46.91 
 
 
497 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  46.39 
 
 
501 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  46.88 
 
 
501 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  42.86 
 
 
502 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  41.2 
 
 
515 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  44.99 
 
 
501 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  41.8 
 
 
505 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  39.16 
 
 
511 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  41.9 
 
 
504 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  40.52 
 
 
503 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  38.52 
 
 
499 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  37.76 
 
 
538 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  37.15 
 
 
538 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  36.92 
 
 
538 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  36.92 
 
 
538 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  37.06 
 
 
538 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  37.3 
 
 
538 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  33.91 
 
 
537 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  31.94 
 
 
529 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  31.73 
 
 
529 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  31.31 
 
 
517 aa  250  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.68 
 
 
502 aa  249  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.93 
 
 
506 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  35.7 
 
 
532 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.53 
 
 
498 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.84 
 
 
505 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  35.48 
 
 
524 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  35.74 
 
 
481 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  35.12 
 
 
513 aa  239  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.26 
 
 
508 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.07 
 
 
508 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.19 
 
 
507 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  35.28 
 
 
507 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  33.12 
 
 
524 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  35.73 
 
 
514 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
522 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
508 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.53 
 
 
513 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  32.53 
 
 
513 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  32.53 
 
 
513 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  31.61 
 
 
514 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  34.05 
 
 
527 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.33 
 
 
526 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  31.36 
 
 
508 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  31.38 
 
 
507 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  33.54 
 
 
507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  33.54 
 
 
522 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  32.28 
 
 
525 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  32.15 
 
 
517 aa  220  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  33.19 
 
 
518 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.83 
 
 
508 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  30.75 
 
 
510 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  33.12 
 
 
524 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>