127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2064 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  60.97 
 
 
502 aa  663    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  100 
 
 
500 aa  1034    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  54.69 
 
 
510 aa  590  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  55.04 
 
 
501 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  54.62 
 
 
509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  55.33 
 
 
503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  53.43 
 
 
499 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  53.43 
 
 
499 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  53.41 
 
 
506 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  53.88 
 
 
507 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  54.64 
 
 
498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  52.82 
 
 
499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  53.29 
 
 
504 aa  555  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  51.93 
 
 
497 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  55.62 
 
 
502 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  52.61 
 
 
501 aa  537  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  53.2 
 
 
497 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  48.79 
 
 
498 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  52.11 
 
 
505 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  51.41 
 
 
505 aa  519  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  48.29 
 
 
495 aa  519  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  49.8 
 
 
509 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  48.09 
 
 
502 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  48.08 
 
 
503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  48.28 
 
 
503 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  47.88 
 
 
503 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  48.08 
 
 
503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  53.01 
 
 
505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  54.4 
 
 
511 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  47.8 
 
 
500 aa  511  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  46.26 
 
 
496 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  47.86 
 
 
506 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  48.79 
 
 
740 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  48.89 
 
 
496 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  47.68 
 
 
510 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  46.87 
 
 
494 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  45.18 
 
 
496 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  48.38 
 
 
492 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  49.09 
 
 
504 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  46.15 
 
 
505 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  48.69 
 
 
512 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  45.66 
 
 
497 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  46.84 
 
 
507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  45.82 
 
 
502 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  46.91 
 
 
518 aa  458  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  45.23 
 
 
497 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  45.55 
 
 
501 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  44.44 
 
 
503 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  45.14 
 
 
501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  44.11 
 
 
497 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  42.72 
 
 
511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  44.04 
 
 
523 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  43.06 
 
 
515 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  41.82 
 
 
505 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  43.2 
 
 
501 aa  425  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  41.88 
 
 
503 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  43.43 
 
 
504 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  38.91 
 
 
499 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.94 
 
 
538 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  34.56 
 
 
538 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  34.75 
 
 
538 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.56 
 
 
538 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.75 
 
 
538 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.24 
 
 
538 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  33.46 
 
 
537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.61 
 
 
529 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.61 
 
 
529 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  35.77 
 
 
532 aa  266  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.09 
 
 
502 aa  266  8.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.47 
 
 
506 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.76 
 
 
505 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.76 
 
 
508 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  35.14 
 
 
522 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.56 
 
 
508 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  37.21 
 
 
524 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  31.34 
 
 
517 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  33.67 
 
 
481 aa  246  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  35.29 
 
 
527 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.73 
 
 
508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  32.62 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  31.02 
 
 
514 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  33.14 
 
 
508 aa  231  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.97 
 
 
514 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  31.19 
 
 
508 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  30.59 
 
 
499 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.36 
 
 
498 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  34.55 
 
 
524 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  32.75 
 
 
508 aa  226  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  31.37 
 
 
518 aa  226  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  30.23 
 
 
524 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  30.29 
 
 
501 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  30.1 
 
 
501 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  30.79 
 
 
503 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  30.38 
 
 
507 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  31.21 
 
 
507 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.47 
 
 
526 aa  223  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  31.63 
 
 
524 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.69 
 
 
513 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  32.69 
 
 
513 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  30.68 
 
 
507 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>