129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3937 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  100 
 
 		 502 aa  1036    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  50 
 
 		 504 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  50 
 
 		 503 aa  524  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  47.01 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  47.51 
 
 		 503 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  48.68 
 
 		 498 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  46.69 
 
 		 501 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  47.28 
 
 		 510 aa  472  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  47.08 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  47.01 
 
 		 504 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  44.8 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  46.26 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  46.32 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  45.4 
 
 		 495 aa  463  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  45.16 
 
 		 503 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  45.36 
 
 		 503 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  44.96 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  45.16 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  45.82 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  45.71 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  45.16 
 
 		 496 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  45.78 
 
 		 492 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  45.44 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  45.07 
 
 		 494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  44.65 
 
 		 496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  47.17 
 
 		 740 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  43.31 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  44.66 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  44.67 
 
 		 496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  45 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  47.2 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  44.82 
 
 		 505 aa  445  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  44.25 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  43.79 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  44.83 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  44.42 
 
 		 499 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  44.02 
 
 		 499 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  44.65 
 
 		 518 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  44.11 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  43.93 
 
 		 507 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  43.56 
 
 		 506 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  40.48 
 
 		 511 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  42.48 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  42.69 
 
 		 507 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  44.95 
 
 		 511 aa  425  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  43.35 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  43.6 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  42.39 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  41.96 
 
 		 503 aa  415  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  44.11 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  41.1 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  42.24 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  41.62 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  40.56 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  40.77 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  40.93 
 
 		 523 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  42.54 
 
 		 502 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  36.51 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  36.7 
 
 		 538 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  36.24 
 
 		 538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  36.24 
 
 		 538 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  36.24 
 
 		 538 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.8 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  36.62 
 
 		 538 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  36.48 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.27 
 
 		 502 aa  263  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  32.65 
 
 		 529 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  32.65 
 
 		 529 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  35.1 
 
 		 501 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.59 
 
 		 537 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  35.31 
 
 		 501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  35.51 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  32.62 
 
 		 532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  34.96 
 
 		 503 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  35.93 
 
 		 507 aa  250  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  37.09 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  37.55 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.43 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.97 
 
 		 507 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.43 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  34.38 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.24 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  38.52 
 
 		 522 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  34.39 
 
 		 514 aa  240  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  32.15 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  34.61 
 
 		 524 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.84 
 
 		 517 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  35.38 
 
 		 508 aa  237  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 517 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.61 
 
 		 498 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  32.81 
 
 		 514 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  33.07 
 
 		 527 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  32.2 
 
 		 524 aa  230  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  32.12 
 
 		 526 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  33.53 
 
 		 524 aa  226  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  32.02 
 
 		 520 aa  226  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  32.86 
 
 		 510 aa  226  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  32.32 
 
 		 528 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>