127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0992 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  100 
 
 		 496 aa  1030    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  65.03 
 
 		 506 aa  695    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  56.45 
 
 		 497 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  52.75 
 
 		 499 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  52.75 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  52.95 
 
 		 499 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  53.35 
 
 		 497 aa  551  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  51.72 
 
 		 504 aa  548  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  50.5 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  49.8 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  49.49 
 
 		 494 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  49.49 
 
 		 495 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  49.9 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  51.12 
 
 		 510 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  48.28 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  49.39 
 
 		 496 aa  521  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  49.7 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  50.1 
 
 		 496 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  49.4 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 503 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 503 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  48.38 
 
 		 503 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  48.38 
 
 		 503 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  50.31 
 
 		 497 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  49.18 
 
 		 740 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  46.26 
 
 		 500 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  47.27 
 
 		 510 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  47.46 
 
 		 502 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  48.7 
 
 		 502 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  48.27 
 
 		 492 aa  501  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  48.68 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  47.46 
 
 		 501 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  47.96 
 
 		 523 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  46.86 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  46.51 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  47.98 
 
 		 505 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  47.14 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  46.23 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  47.49 
 
 		 498 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  47.65 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  45.73 
 
 		 501 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  46.52 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  47.53 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  47.6 
 
 		 502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  44.56 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  45.16 
 
 		 502 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  46.14 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  44.9 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  42.45 
 
 		 503 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  43.12 
 
 		 501 aa  428  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  43.12 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  42.25 
 
 		 512 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  43.18 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  39.57 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  41.58 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  41.02 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  39.03 
 
 		 499 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  35.29 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  32.63 
 
 		 529 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  32.63 
 
 		 529 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  33.71 
 
 		 538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.71 
 
 		 538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  33.52 
 
 		 538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  33.52 
 
 		 538 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  33.52 
 
 		 538 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.16 
 
 		 537 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33.08 
 
 		 532 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  35.92 
 
 		 524 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.84 
 
 		 502 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.76 
 
 		 517 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.67 
 
 		 506 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  32.68 
 
 		 498 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  34.1 
 
 		 524 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 522 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.53 
 
 		 507 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.82 
 
 		 508 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  32.5 
 
 		 507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  31.85 
 
 		 481 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  31.64 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  31.67 
 
 		 522 aa  230  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  32.36 
 
 		 524 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  31.54 
 
 		 507 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.76 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  31.56 
 
 		 508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  31.14 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  31.09 
 
 		 507 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  31.36 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  30.99 
 
 		 508 aa  220  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  32.7 
 
 		 518 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  31.85 
 
 		 508 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  32.42 
 
 		 499 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  32.9 
 
 		 507 aa  216  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  31.92 
 
 		 513 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  31.92 
 
 		 513 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  31.4 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  31.6 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  31.25 
 
 		 514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>